More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0982 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  100 
 
 		 150 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  96.27 
 
 		 235 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  96.27 
 
 		 235 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  96.27 
 
 		 229 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  96.27 
 
 		 184 aa  265  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  94.03 
 
 		 273 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  94.03 
 
 		 289 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  84.09 
 
 		 273 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  75.76 
 
 		 233 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  71.3 
 
 		 183 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1309  integrase catalytic subunit  55.64 
 
 		 270 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  94.29 
 
 		 58 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  94.29 
 
 		 58 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  26.15 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  26.15 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  31.34 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  31.75 
 
 		 304 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  33.07 
 
 		 276 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  26.15 
 
 		 271 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  30.95 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  28.68 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  29.29 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  28.68 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  28.68 
 
 		 302 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  28.68 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0359  ISEc16, orfB  29.6 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  33.86 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1009  transposase  29.85 
 
 		 267 aa  63.9  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00631408  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  29.5 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  29.5 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  35.59 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  35.59 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  35.59 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0042  ISEc17, transposase orfB  29.6 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  29.5 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  29.5 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  29.08 
 
 		 285 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A33  transposase  29.1 
 
 		 280 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00683665  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  32.28 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  32.28 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  32.28 
 
 		 296 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  28.8 
 
 		 271 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02696  putative transposase for IS3  28.8 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.367073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  28.8 
 
 		 288 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  28.8 
 
 		 298 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01380  integrase core domain protein  71.05 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  28.46 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  28.8 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  28.35 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  28.35 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  28.35 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  27.69 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  27.69 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  27.69 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  27.69 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  27.69 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  27.69 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  27.69 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2140  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.746404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2391  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  26.72 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  28 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1118  ISEc16, orfB  30 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  28.78 
 
 		 276 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  28.33 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  28.57 
 
 		 291 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>