More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2227 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  96.55 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  96.55 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  96.55 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  96.55 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  94.83 
 
 		 289 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  94.83 
 
 		 273 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  94.83 
 
 		 58 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  84.48 
 
 		 273 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  77.59 
 
 		 183 aa  96.7  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  76.36 
 
 		 233 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01380  integrase core domain protein  72.73 
 
 		 60 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  94.29 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1309  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  44.44 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  47.17 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16560  hypothetical protein  92 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  41.51 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  41.51 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  41.51 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  40.74 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  41.51 
 
 		 276 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  41.51 
 
 		 276 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  44.23 
 
 		 273 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  44.23 
 
 		 273 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  44.23 
 
 		 273 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  44.23 
 
 		 273 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  44.23 
 
 		 273 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 273 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 273 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 273 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  39.62 
 
 		 295 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  43.14 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  41.18 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2009  putative transposase  39.22 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  38.6 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4648  integrase catalytic region  41.18 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  39.62 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 280 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  40.38 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0978  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.43017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2268  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2283  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1441  putative transposase  39.22 
 
 		 90 aa  48.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2054  putative transposase  39.22 
 
 		 90 aa  48.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2145  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1483  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 240 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0188  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0908748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2120  A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1313  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336446  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0001  integrase core subunit  35.29 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.274298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  40.38 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  39.62 
 
 		 305 aa  48.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0156  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0152  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 240 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.881638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  41.18 
 
 		 275 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  41.18 
 
 		 275 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0817  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0884  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293625  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0923  IS407A, transposase OrfB  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0979  IS1404 transposase  41.18 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>