More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1950 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  100 
 
 
229 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  95.5 
 
 
273 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  95.5 
 
 
289 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  82.88 
 
 
273 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  72.6 
 
 
233 aa  343  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1309  integrase catalytic subunit  58.99 
 
 
270 aa  250  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  96.27 
 
 
150 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  75.74 
 
 
183 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0981  integrase core subunit  90.77 
 
 
94 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  98.28 
 
 
58 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  96.55 
 
 
58 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  32.27 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  32.46 
 
 
276 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  29.65 
 
 
293 aa  98.6  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  30.87 
 
 
275 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  29.76 
 
 
271 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  31 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  29.76 
 
 
271 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  33.05 
 
 
273 aa  95.1  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  33.05 
 
 
273 aa  95.1  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  33.05 
 
 
273 aa  95.1  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  29.76 
 
 
271 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  30.86 
 
 
306 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  30.86 
 
 
306 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  30.86 
 
 
307 aa  91.7  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  30.86 
 
 
306 aa  91.7  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  30.86 
 
 
307 aa  91.7  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.7  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  28.31 
 
 
285 aa  91.7  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  27.63 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  32.53 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 
288 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  32.69 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  30.33 
 
 
307 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  32.9 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  33.19 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  33.19 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  33.19 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  33.19 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  33.19 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01380  integrase core domain protein  74.55 
 
 
60 aa  88.6  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  30.67 
 
 
296 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  30.67 
 
 
296 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  30.67 
 
 
296 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  29.26 
 
 
278 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  31.36 
 
 
273 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  31.36 
 
 
273 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  31.36 
 
 
273 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  31.36 
 
 
273 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  31.36 
 
 
273 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  31.19 
 
 
279 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  31.19 
 
 
279 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  31.19 
 
 
279 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  28.94 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  27.75 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  27.75 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  27.75 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  27.75 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  27.75 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  27.75 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  27.75 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  27.75 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  31.06 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  31.06 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  31.06 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  31.06 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0293  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0154379  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0390  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.50729  normal  0.30178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0647  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0902  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2062  integrase catalytic subunit  27.52 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0588444 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>