168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0045 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0045  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0049  SNARE associated Golgi protein  93.53 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  27.18 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1613  DedA  31.86 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1518  DedA  31.37 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2351  hypothetical protein  30.92 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1522  hypothetical protein  32.5 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00239621  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  30.85 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  32.49 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  36.11 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  31.98 
 
 
331 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  29.95 
 
 
330 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.14 
 
 
457 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  29.95 
 
 
330 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  29.95 
 
 
330 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  29.65 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  29.65 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  29.65 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.91 
 
 
521 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  29.65 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  33.5 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  33.5 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  29.95 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  33.5 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  33.5 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  33.5 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  33.5 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  33.5 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  29.15 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  29.44 
 
 
330 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  31.95 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  29.69 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  24.37 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  29.45 
 
 
331 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  29.56 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  32.65 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  30.81 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.79 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  32 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  25.47 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  25.47 
 
 
212 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  30.1 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  32.48 
 
 
331 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.263557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  29.61 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.61 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  29.61 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  29.61 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  29.61 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  29.61 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  29.61 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  29.48 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  29.61 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  31.87 
 
 
330 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4284  SNARE associated Golgi protein  33.55 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.747382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  20 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  31.74 
 
 
334 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  28.9 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  30.27 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  29.79 
 
 
187 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  23.5 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  23.29 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  22.16 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
204 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  26.8 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  24.2 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  27.36 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 
312 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  29.37 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  30.77 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0149  hypothetical protein  22.99 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  25.87 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  25.87 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  30.77 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0255  DedA protein  22.38 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  27.55 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  25.17 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  34.38 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  32.48 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  34.38 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  24.23 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  31.36 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  25.77 
 
 
330 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  28.21 
 
 
235 aa  52  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.35 
 
 
207 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  23.24 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  25.25 
 
 
329 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.87 
 
 
676 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  28.93 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  29.17 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.88 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  29.34 
 
 
328 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  26.56 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  23.83 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  25.15 
 
 
330 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.61 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>