More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4511 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4511  methyltransferase GidB  100 
 
 		 215 aa  417  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4492  methyltransferase GidB  93.95 
 
 		 215 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4356  methyltransferase GidB  92.09 
 
 		 215 aa  370  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4504  methyltransferase GidB  72.41 
 
 		 215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  44 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  44.74 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  41.54 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  40.3 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  38.81 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  38.73 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  41.75 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  36.45 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  39.62 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  38.92 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  41.86 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  39.43 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  36.67 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  36.67 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  35.85 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  35.64 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.51 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  37.59 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  37.59 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  32.14 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  40.83 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 206 aa  97.8  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  35.33 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  39.89 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  36.3 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  38.42 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  37.93 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  41.18 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  38.42 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  33.74 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  36.7 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  33.96 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  37.85 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  39.31 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1057  16S rRNA methyltransferase GidB  37 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.904694 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  33.96 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  44.76 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  39.31 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  39.31 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  37.67 
 
 		 208 aa  95.1  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  37.64 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  32.37 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1321  16S rRNA methyltransferase GidB  39.52 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  38.15 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  36.11 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  32.37 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  37.84 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  29.76 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  37.42 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  29.67 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  38.24 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  38.15 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  37.44 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  30.59 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  35.08 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  41.21 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  35.08 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  36.57 
 
 		 206 aa  91.3  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  40.66 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  34.13 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5046  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  40.94 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  40.94 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  40.34 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  36.31 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  41.21 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  39.77 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  37.64 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  35.42 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  36.46 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  29.86 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  31.13 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  30.14 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1398  16S rRNA methyltransferase GidB  42.34 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046822  hitchhiker  0.000739039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  26.7 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  39.63 
 
 		 235 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  33.54 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  35.42 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>