247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2880 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2880  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.188916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2787  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2694  ATP-dependent protease peptidase subunit  97.24 
 
 
181 aa  335  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.937289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2688  ATP-dependent protease peptidase subunit  87.29 
 
 
181 aa  302  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0922761 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
181 aa  230  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.88 
 
 
204 aa  228  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 
181 aa  227  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.54 
 
 
183 aa  226  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.09 
 
 
187 aa  224  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.88 
 
 
182 aa  222  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.33 
 
 
182 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
177 aa  221  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.45 
 
 
176 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.36 
 
 
178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.44 
 
 
180 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.34 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.88 
 
 
179 aa  218  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  58.56 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.77 
 
 
184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  63.54 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.61 
 
 
174 aa  217  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 
176 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 
176 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
182 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.24 
 
 
187 aa  215  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.61 
 
 
177 aa  215  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 
176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 
186 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.54 
 
 
176 aa  214  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
176 aa  214  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 
186 aa  214  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 
184 aa  214  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 
176 aa  214  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 
176 aa  213  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.13 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 
188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 
186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.86 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
174 aa  212  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 
184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.67 
 
 
178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.32 
 
 
183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
181 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 
190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.29 
 
 
175 aa  211  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  55 
 
 
178 aa  210  7.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
176 aa  210  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0709  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 
188 aa  210  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
176 aa  210  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 
177 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 
184 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 
184 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.89 
 
 
182 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.67 
 
 
206 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.58 
 
 
187 aa  208  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.98 
 
 
180 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
176 aa  207  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
193 aa  207  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.01 
 
 
178 aa  207  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.22 
 
 
188 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0829  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.59 
 
 
178 aa  205  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000238243  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0826  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.92 
 
 
183 aa  205  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0680706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.98 
 
 
180 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.46 
 
 
179 aa  204  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.19 
 
 
189 aa  204  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
176 aa  204  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0737  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.92 
 
 
183 aa  204  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.54 
 
 
176 aa  204  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.45 
 
 
185 aa  204  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 
183 aa  204  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0756  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.18 
 
 
180 aa  202  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.43 
 
 
184 aa  203  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.45 
 
 
185 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
180 aa  203  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.89 
 
 
180 aa  202  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 
189 aa  202  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.89 
 
 
184 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.89 
 
 
185 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
185 aa  201  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.71 
 
 
174 aa  201  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
174 aa  201  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.91 
 
 
188 aa  201  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.61 
 
 
179 aa  201  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>