46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1140 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  33.63 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.82 
 
 		 365 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0449  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.62 
 
 		 379 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0124171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2658  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.62 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0260661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  27.34 
 
 		 384 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  31.54 
 
 		 347 aa  96.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  31.54 
 
 		 347 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6503  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.91 
 
 		 386 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.99 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.96 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.51 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.96 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4850  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.67 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3316  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.67 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  28.35 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4199  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.18 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  31.67 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5024  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.34 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.001184  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  28.9 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  25.69 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  25.58 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0451  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  30.95 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.918848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08210  conjugal transfer protein TraA  27.64 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.51 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.71 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.75 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.89 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3525  type IV secretion system protein VirB6  24.51 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7349  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.83 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.149767 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6157  type IV secretion system protein VirB6  27.75 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  25.26 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0006  conjugal transfer protein  22.64 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2439  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.23 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589519 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7531  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.38 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  normal  0.0598355 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8222  type IV secretion system protein VirB6  29.51 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6401  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.63 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  20.09 
 
 		 1169 aa  48.1  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.69 
 
 		 1444 aa  47  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0855  hypothetical protein  29.57 
 
 		 992 aa  46.6  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  31.58 
 
 		 1468 aa  46.6  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3985  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  41.82 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257562  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0499  VirB6 family type IV secretion system protein  25.32 
 
 		 2758 aa  44.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  40 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.83662 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3651  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  40 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>