55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5083 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  72.52 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  78.45 
 
 		 298 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  42.79 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  35.69 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.97 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.79 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  28.7 
 
 		 384 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  29.44 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.88 
 
 		 385 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5024  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.11 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.001184  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3316  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.33 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4850  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.33 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6503  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.16 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0451  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  31.04 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.918848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.82 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.51 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  23.7 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.83 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  23.94 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4199  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.31 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3525  type IV secretion system protein VirB6  24.26 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.38 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  23.39 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.72 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7531  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.63 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0782422  normal  0.0598355 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08210  conjugal transfer protein TraA  27.8 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0038  putative conjugal transfer protein  25.4 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7349  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.43 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.149767 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  25.6 
 
 		 1169 aa  59.7  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0854  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1242 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.814929  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6401  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.86 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0176  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1562 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0006  conjugal transfer protein  23.15 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623118 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.11 
 
 		 1444 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6157  type IV secretion system protein VirB6  26.54 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  21.66 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6210  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.52 
 
 		 357 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.427299  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0861  VirB6 family type IV secretion system protein  27.14 
 
 		 839 aa  52  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0039  TriE protein  25.61 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0449  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.33 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0124171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2658  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.33 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0260661  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  21.56 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  21.56 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0499  VirB6 family type IV secretion system protein  22.4 
 
 		 2758 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0855  hypothetical protein  25.55 
 
 		 992 aa  48.5  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  23.83 
 
 		 1468 aa  47.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0856  hypothetical protein  26.03 
 
 		 795 aa  47  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0111  TriE protein  21.11 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8222  type IV secretion system protein VirB6  25 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0531  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.28 
 
 		 935 aa  45.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0099  pilx6 protein  24.55 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0519524  normal  0.478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2439  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.75 
 
 		 386 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589519 
 
 
-
 
NC_002978  WD0857  type IV secretion system protein VirB6  23.4 
 
 		 851 aa  43.5  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3708  hypothetical protein  30.89 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0451943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>