33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0164 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 385 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0451  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  89.87 
 
 		 385 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.918848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6503  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  71.17 
 
 		 386 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  71.2 
 
 		 384 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  70.47 
 
 		 389 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4199  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  67.46 
 
 		 383 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4850  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  66.67 
 
 		 383 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3316  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  66.67 
 
 		 383 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.53 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.03 
 
 		 304 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.97 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.97 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  30.77 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.5 
 
 		 298 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.8 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.33 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  25.91 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  25.91 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.35 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.37 
 
 		 314 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5024  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.23 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.001184  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7349  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.31 
 
 		 332 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.149767 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0006  conjugal transfer protein  23.81 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623118 
 
 
-
 
NC_002978  WD0857  type IV secretion system protein VirB6  29.03 
 
 		 851 aa  47.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  27.19 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  26.09 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0038  putative conjugal transfer protein  21.43 
 
 		 350 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5415  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5010  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  22.62 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2439  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.08 
 
 		 386 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589519 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6157  type IV secretion system protein VirB6  26.73 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>