39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4441 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 376 aa  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.93 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.17 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  25.94 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6401  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.52 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  24.51 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  24.86 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  26.69 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  29.63 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  26.58 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0006  conjugal transfer protein  24.16 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623118 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.03 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.06 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.71 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.62 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.05 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.72 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3316  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.5 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4850  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.5 
 
 		 383 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.64 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.83662 
 
 
-
 
NC_002978  WD0857  type IV secretion system protein VirB6  34.88 
 
 		 851 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4199  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.25 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6503  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.1 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0854  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1242 aa  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.814929  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3985  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.11 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257562  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0859  VirB6 family type IV secretion system protein  19.33 
 
 		 1149 aa  51.6  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0862  type IV secretion system protein VirB6  29.87 
 
 		 873 aa  51.6  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3651  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.64 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019924 
 
 
-
 
NC_002978  WD0855  hypothetical protein  23.99 
 
 		 992 aa  49.7  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  27.17 
 
 		 1169 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.11 
 
 		 1444 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6210  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.73 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.427299  normal  0.125195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.97 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  33.78 
 
 		 1468 aa  46.6  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0856  hypothetical protein  38.24 
 
 		 795 aa  46.6  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.02 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0531  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.5 
 
 		 935 aa  43.9  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0499  VirB6 family type IV secretion system protein  27.85 
 
 		 2758 aa  43.1  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  20.97 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>