18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3985 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_3985  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 358 aa  697    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257562  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3651  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  95.81 
 
 		 358 aa  625  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019924 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  87.47 
 
 		 359 aa  589  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.83662 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  29.31 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  29.69 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  30.59 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08210  conjugal transfer protein TraA  25.85 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5024  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  32.2 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.001184  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 795 aa  47.4  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0862  type IV secretion system protein VirB6  35.53 
 
 		 873 aa  46.6  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.31 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  40.62 
 
 		 1169 aa  46.2  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0857  type IV secretion system protein VirB6  31.37 
 
 		 851 aa  45.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  27.78 
 
 		 1468 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.78 
 
 		 1444 aa  44.7  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.18 
 
 		 345 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0861  VirB6 family type IV secretion system protein  25.14 
 
 		 839 aa  42.7  0.009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  24.84 
 
 		 342 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>