38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0175 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  702    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  96.53 
 
 		 346 aa  682    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.51 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.68 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  27.18 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.27 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.31 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.58 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0861  VirB6 family type IV secretion system protein  28.06 
 
 		 839 aa  60.5  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.34 
 
 		 1444 aa  59.7  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3651  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.63 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019924 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3985  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  33.75 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257562  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  31.95 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.41 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  31.95 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  26.46 
 
 		 1468 aa  56.6  0.0000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  26.37 
 
 		 1169 aa  56.2  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.63 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.83662 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  19.55 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.09 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  21.72 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0039  TriE protein  22.03 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0855  hypothetical protein  27.59 
 
 		 992 aa  55.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2439  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.98 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589519 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0499  VirB6 family type IV secretion system protein  21.48 
 
 		 2758 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.09 
 
 		 385 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.35 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a014  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  22.84 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  22.93 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  22.93 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0038  putative conjugal transfer protein  25.19 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0854  hypothetical protein  20.19 
 
 		 1242 aa  44.3  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.814929  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0449  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  21.67 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0124171  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0111  TriE protein  25.24 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0859  VirB6 family type IV secretion system protein  24.35 
 
 		 1149 aa  43.5  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2658  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  21.67 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0260661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>