16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3809 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  100 
 
 		 359 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.83662 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3651  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  86.35 
 
 		 358 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019924 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3985  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  87.47 
 
 		 358 aa  580  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  27.76 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  27.61 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.58 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.09 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0862  type IV secretion system protein VirB6  36.84 
 
 		 873 aa  47.8  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5024  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  31.46 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.001184  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0856  hypothetical protein  24.31 
 
 		 795 aa  46.2  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  39.06 
 
 		 1169 aa  45.8  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0857  type IV secretion system protein VirB6  29.41 
 
 		 851 aa  44.7  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  27.78 
 
 		 1468 aa  43.5  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.78 
 
 		 1444 aa  43.1  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0861  VirB6 family type IV secretion system protein  25.1 
 
 		 839 aa  43.1  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  26.92 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.281645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>