39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0157 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  96.53 
 
 
346 aa  682    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  700    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.86 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.2 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  27.18 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.76 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.61 
 
 
298 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.23 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0861  VirB6 family type IV secretion system protein  24.8 
 
 
839 aa  62  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.69 
 
 
291 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.79 
 
 
1444 aa  60.8  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3651  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  29.01 
 
 
358 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019924 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  26.85 
 
 
1468 aa  59.3  0.00000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3985  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  33.75 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257562  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  26.37 
 
 
1169 aa  56.6  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  20.57 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.17 
 
 
345 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.61 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.83662 
 
 
-
 
NC_002978  WD0855  hypothetical protein  27.59 
 
 
992 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  31.36 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  31.36 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.6 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2439  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.44 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.589519 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  20.52 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0039  TriE protein  21.61 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0499  VirB6 family type IV secretion system protein  21.48 
 
 
2758 aa  49.7  0.00008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.17 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.57 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0038  putative conjugal transfer protein  24.46 
 
 
350 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.19 
 
 
385 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  24.79 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  21.22 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_002978  WD0854  hypothetical protein  21.13 
 
 
1242 aa  43.9  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.814929  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0111  TriE protein  24.81 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a014  conjugal transfer protein TrbL/VirB6  21.67 
 
 
336 aa  43.5  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0859  VirB6 family type IV secretion system protein  25.13 
 
 
1149 aa  43.5  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0034  cmgB6  20.62 
 
 
332 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3525  type IV secretion system protein VirB6  23.91 
 
 
295 aa  42.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0449  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  21.29 
 
 
379 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0124171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>