25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0064 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0064  type IV secretion system protein VirB6  100 
 
 
347 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0058  type IV secretion system protein VirB6  100 
 
 
347 aa  689    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6328  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  51.13 
 
 
365 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  31.54 
 
 
291 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0111  TriE protein  25.47 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2654  putative type IV secretion system protein VirB6/TraH  24.82 
 
 
389 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254116  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.53 
 
 
304 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.26 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0868  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.45 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3316  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.46 
 
 
383 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4850  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.46 
 
 
383 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6503  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.51 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  31.95 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0164  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.45 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1757  putative type IV secretion system protein VirB6  24.3 
 
 
384 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0039  TriE protein  23.36 
 
 
364 aa  56.6  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  31.36 
 
 
346 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4199  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.03 
 
 
383 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.18 
 
 
314 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08210  conjugal transfer protein TraA  22.76 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  21.56 
 
 
310 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.05 
 
 
298 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0006  conjugal transfer protein  23.89 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623118 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  23.58 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.81 
 
 
298 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.803128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>