10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8222 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8222  type IV secretion system protein VirB6  100 
 
 		 295 aa  584  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6157  type IV secretion system protein VirB6  68.14 
 
 		 295 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0688028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3525  type IV secretion system protein VirB6  30.46 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.92 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0680  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.92 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.8 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.92 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  26.7 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5005  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.45 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0328089  normal  0.438653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1140  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.86 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>