33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0860 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0860  VirB6 family type IV secretion system protein  100 
 
 
1169 aa  2398    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.921754  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0855  hypothetical protein  29.77 
 
 
992 aa  395  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0530  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.49 
 
 
1444 aa  383  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0498  VirB6 family type IV secretion system protein  27.66 
 
 
1468 aa  345  2e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0861  VirB6 family type IV secretion system protein  27.89 
 
 
839 aa  214  7.999999999999999e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0531  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.43 
 
 
935 aa  198  6e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0497  VirB6 family type IV secretion system protein  26.78 
 
 
922 aa  193  1e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.915079  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0856  hypothetical protein  23.09 
 
 
795 aa  154  7e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0499  VirB6 family type IV secretion system protein  28 
 
 
2758 aa  140  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0859  VirB6 family type IV secretion system protein  32.46 
 
 
1149 aa  134  7.999999999999999e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0529  putative Type IV secretory pathway VirB6 components  30.47 
 
 
2030 aa  124  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0854  hypothetical protein  30.41 
 
 
1242 aa  112  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.814929  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4559  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  26.24 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901253  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0862  type IV secretion system protein VirB6  40.43 
 
 
873 aa  74.3  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6401  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.55 
 
 
342 aa  65.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0496  type IV secretion system protein VirB6  22.84 
 
 
826 aa  65.1  0.000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.110735  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4373  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.81 
 
 
298 aa  64.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.803128 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4174  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.64 
 
 
336 aa  63.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0857  type IV secretion system protein VirB6  28.85 
 
 
851 aa  62  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5083  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  25.6 
 
 
310 aa  60.1  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0532  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  22.67 
 
 
839 aa  59.7  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9816  type IV secretion protein AvhB6  22.79 
 
 
342 aa  58.9  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5818  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.09 
 
 
350 aa  57.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0157  hypothetical protein  26.37 
 
 
346 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0252  Type IV secretory pathway AvhB6 protein  25.49 
 
 
328 aa  57.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0175  hypothetical protein  26.37 
 
 
346 aa  56.2  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4343  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.3 
 
 
298 aa  53.5  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2439  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  23.78 
 
 
386 aa  52.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.589519 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4441  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  27.17 
 
 
376 aa  48.9  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418646  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3651  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  37.68 
 
 
358 aa  46.2  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019924 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3985  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  40.62 
 
 
358 aa  46.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257562  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3809  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  39.06 
 
 
359 aa  45.8  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.83662 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5024  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  28.75 
 
 
327 aa  45.8  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.001184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>