90 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
RSP_3838  CDS  NC_009007  4  1839  +  1836  capsule polysaccharide export protein  YP_001033800  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3839  CDS  NC_009007  1856  2677  +  822  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  YP_001033801  hitchhiker  0.00536302  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3840  CDS  NC_009007  4216  5670  -  1455  ATPase, ParA type  YP_001033803  normal  0.535208  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3842  CDS  NC_009007  7374  8312  +  939  glycosyl transferase family protein  YP_001033805  normal  0.051073  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3843  CDS  NC_009007  8376  8939  +  564  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related protein  YP_001033806  normal  0.0675992  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3844  CDS  NC_009007  8943  9983  +  1041  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  YP_001033807  normal  0.919278  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3845  CDS  NC_009007  9980  10831  +  852  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  YP_001033808  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3846  CDS  NC_009007  11693  12475  -  783  putative deacetylase sulfotransferase  YP_001033810  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3848  CDS  NC_009007  10828  11718  +  891  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  YP_001033809  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3849  CDS  NC_009007  13769  14605  +  837  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  YP_001033812  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3850  CDS  NC_009007  14738  15331  -  594  Generic methyltransferase  YP_001033813  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3852  CDS  NC_009007  16649  18823  -  2175  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  YP_001033815  normal  0.382058  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3853  CDS  NC_009007  18938  20710  -  1773  O-linked acetylglucosamine transferase  YP_001033816  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3854  CDS  NC_009007  20963  25648  +  4686  ICE nucleation protein  YP_001033817  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3855  CDS  NC_009007  25733  28822  -  3090  hemolysin-type calcium-binding protein  YP_001033818  normal  0.460711  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3856  CDS  NC_009007  29134  29772  +  639  hypothetical protein  YP_001033819  normal  0.134324  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3858  CDS  NC_009007  30361  31134  -  774  sulfate/molybdate ABC transporter ATPase  YP_001033821  normal  0.177813  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3859  CDS  NC_009007  31092  31967  -  876  sulfate/molybdate ABC transporter inner membrane protein  YP_001033822  normal  0.243092  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3860  CDS  NC_009007  31971  32804  -  834  sulfate/molybdate ABC transporter inner membrane protein  YP_001033823  normal  0.384915  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3861  CDS  NC_009007  32806  33810  -  1005  sulfate/molybdate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_001033824  normal  0.830812  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3862  CDS  NC_009007  34238  35137  -  900  chromosome replication initiation inhibitor protein  YP_001033825  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3864  CDS  NC_009007  35858  36484  +  627  negative transcriptional regulator  YP_001033826  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3865  CDS  NC_009007  36635  37144  -  510  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001033827  normal  0.332073  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3866  CDS  NC_009007  37658  38068  -  411  hypothetical protein  YP_001033828  normal  0.0422499  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3867  CDS  NC_009007  38226  38678  +  453  carboxymuconolactonedecarboxylase/ alkylhydropero xidase  YP_001033829  normal  0.275724  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3868  CDS  NC_009007  38843  39430  -  588  molybdate ABC transporter inner membrane protein  YP_001033830  normal  0.175484  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3869  CDS  NC_009007  39522  40628  -  1107  ABC molybdate transporter, ATPase subunit ModC  YP_001033831  normal  0.340875  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3871  CDS  NC_009007  41323  42099  -  777  ABC molybdate transporter, periplasmic binding protein ModA  YP_001033832  normal  0.609422  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3872  CDS  NC_009007  42634  42837  -  204  molybdenum-pterin binding protein  YP_001033833  normal  0.262463  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3873  CDS  NC_009007  43175  44008  -  834  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  YP_001033834  normal  0.124116  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3874  CDS  NC_009007  44048  44836  -  789  transcriptional repressor, ModE  YP_001033835  normal  0.0735734  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3876  CDS  NC_009007  45840  46589  +  750  hypothetical protein  YP_001033836  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3877  CDS  NC_009007  46629  47489  -  861  glycoside hydrolase family protein  YP_001033837  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3878  CDS  NC_009007  47898  48743  +  846  flagellin  YP_001033838  normal  0.466019  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3879  CDS  NC_009007  48833  49198  +  366  flagellar biosynthesis regulatory protein FlaF  YP_001033839  normal  0.113275  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3880  CDS  NC_009007  49195  49602  +  408  flagellar biosynthesis repressor FlbT  YP_001033840  normal  0.0966721  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3881  CDS  NC_009007  49599  50387  +  789  flagellar basal-body rod protein FLGF  YP_001033841  normal  0.0287836  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3882  CDS  NC_009007  50670  51698  -  1029  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  YP_001033842  normal  0.0441642  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3883  CDS  NC_009007  51698  52714  -  1017  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  YP_001033843  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3884  CDS  NC_009007  52764  53939  -  1176  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  YP_001033844  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3885  CDS  NC_009007  53941  55437  -  1497  hypothetical protein  YP_001033845  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3886  CDS  NC_009007  55455  56495  -  1041  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  YP_001033846  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3887  CDS  NC_009007  56601  57782  +  1182  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_001033847  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3888  CDS  NC_009007  57804  58550  +  747  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001033848  normal  0.689066  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3889  CDS  NC_009007  59093  59803  -  711  Short-chain dehydrogenase/reductase  YP_001033849  normal  0.521289  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3890  CDS  NC_009007  59815  60720  -  906  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  YP_001033850  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3891  CDS  NC_009007  60710  61663  -  954  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  YP_001033851  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3892  CDS  NC_009007  61744  63300  -  1557  ABC di/oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_001033852  normal  0.206545  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3893  CDS  NC_009007  63440  64171  +  732  GntR family transcriptional regulator  YP_001033853  hitchhiker  0.000000224678  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3894  CDS  NC_009007  64513  64938  +  426  ring hydroxylating dioxygenase, alpha- subunit  YP_001033854  unclonable  0.0000000000760219  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3896  CDS  NC_009007  88561  89823  -  1263  replication protein C  YP_001033868  hitchhiker  0.00360794  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3899  CDS  NC_009007  84729  85592  -  864  hypothetical protein  YP_001033867  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3901  CDS  NC_009007  81406  82302  +  897  virC1 gene, ATPase  YP_001033866  normal  0.691953  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3902  CDS  NC_009007  79965  80984  +  1020  hypothetical protein  YP_001033865  normal  0.0303474  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3903  CDS  NC_009007  79343  79975  +  633  hypothetical protein  YP_001033864  normal  0.425986  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3904  CDS  NC_009007  76011  79346  +  3336  hypothetical protein  YP_001033863  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3905  CDS  NC_009007  73732  76014  +  2283  hypothetical protein  YP_001033862  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3906  CDS  NC_009007  72751  73572  -  822  DSBA oxidoreductase  YP_001033861  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3907  CDS  NC_009007  72220  72711  -  492  hypothetical protein  YP_001033860  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3908  CDS  NC_009007  71661  72218  -  558  hypothetical protein  YP_001033859  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3909  CDS  NC_009007  71267  71668  -  402  hypothetical protein  YP_001033858  normal  0.619524  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3910  CDS  NC_009007  70929  71270  -  342  hypothetical protein  YP_001033857  normal  0.190915  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3914    NC_009007  67149  67832  -  684      normal  0.578248  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3916    NC_009007  65019  66020  +  1002      hitchhiker  0.000000151881  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3917  CDS  NC_009007  112923  113723  -  801  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  YP_001033886  normal  0.0712312  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3918  CDS  NC_009007  110604  112859  -  2256  hypothetical protein  YP_001033885  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3919  CDS  NC_009007  109611  110603  -  993  hypothetical protein  YP_001033884  normal  0.455905  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3920  CDS  NC_009007  108095  109453  +  1359  hypothetical protein  YP_001033883  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3921  CDS  NC_009007  106191  107492  -  1302  hypothetical protein  YP_001033882  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3922  CDS  NC_009007  105068  106009  -  942  hemolysin-type calcium-binding protein  YP_001033881  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3923  CDS  NC_009007  103630  104952  -  1323  hypothetical protein  YP_001033880  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3924  CDS  NC_009007  102851  103540  -  690  hypothetical protein  YP_001033879  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3925  CDS  NC_009007  101774  102826  +  1053  hypothetical protein  YP_001033878  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3926  CDS  NC_009007  100650  101654  +  1005  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001033877  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3927  CDS  NC_009007  99745  100365  +  621  hypothetical protein  YP_001033876  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3929  CDS  NC_009007  96780  98174  -  1395  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_001033875  normal  0.114623  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3930  CDS  NC_009007  96343  96783  -  441  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  YP_001033874  normal  0.6522  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3931  CDS  NC_009007  95981  96346  -  366  hypothetical protein  YP_001033873  normal  0.416818  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3933  CDS  NC_009007  95044  95727  -  684  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_001033872  normal  0.056458  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3935  CDS  NC_009007  92603  94096  -  1494  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  YP_001033870  normal  0.455536  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_3936  CDS  NC_009007  91755  92606  -  852  H(+)-transporting ATP synthase, subunit gamma  YP_001033869  normal  0.0549887  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_6257  CDS  NC_009007  6361  7323  +  963  plasmid replication initiator protein RepA  YP_001033804  normal  0.0332659  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_6258  CDS  NC_009007  12842  13567  -  726  hypothetical protein  YP_001033811  normal  1  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7012  CDS  NC_009007  94086  94790  -  705  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  YP_001033871  normal  0.303769  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7084  CDS  NC_009007  2976  4091  -  1116  ParB-like nuclease  YP_001033802  normal  0.403712  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7361  CDS  NC_009007  15354  16652  -  1299  membrane-fusion protein  YP_001033814  normal  0.661389  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7362  CDS  NC_009007  29777  30286  -  510  AsnC family transcriptional regulator  YP_001033820  normal  0.0360859  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7363  CDS  NC_009007  66691  66981  -  291  hypothetical protein  YP_001033855  normal  0.0640425  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7364  CDS  NC_009007  69023  70225  -  1203  putative Mrr restriction system protein  YP_001033856  hitchhiker  0.00238713  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
RSP_7365    NC_009007  90984  91490  +  507      hitchhiker  0.000000311947  n/a    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>