138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3930 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
146 aa  283  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  99.32 
 
 
146 aa  280  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.23 
 
 
153 aa  126  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.84 
 
 
143 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.77 
 
 
146 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1880  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.38 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.987972 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.73 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.88 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
151 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
151 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  42.7 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.84 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.6 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.27 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.2 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.42 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
130 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.8 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0971  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.14 
 
 
135 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.69 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18391  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.14 
 
 
135 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1064  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.51 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.381379  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15581  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.65 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
139 aa  50.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.23 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  37.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0503  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.79 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0445749  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2172  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.28 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0951  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.2 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0373454  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.18 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.05 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.4 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.55 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.4 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.24 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.24 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.95 
 
 
138 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.79 
 
 
135 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16411  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.662603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.97 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.35 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.35 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  34.57 
 
 
87 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.05 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.03 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1532  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.67 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1932  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.89 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.09 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.47 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.45 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.88 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.72 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.96 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.96 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.96 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16181  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.55 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.96 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.57 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.53 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.28 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.91 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.91 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.04 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>