45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3880 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4160  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00283786  normal  0.231077 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3880  flagellar biosynthesis repressor FlbT  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0966721  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4201  flagellar biosynthesis repressor FlbT  66.67 
 
 		 134 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2972  flagellar biosynthesis repressor FlbT  68.7 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.229267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3359  flagellar biosynthesis repressor FlbT  64.62 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4081  hypothetical protein  83.33 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13747  normal  0.0456765 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1964  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.52 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2889  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.97 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078203  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1491  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.16 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.194019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3373  flagellar FlbT family protein  31.5 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0768  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.5 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4437  flagellar biosynthesis repressor FlbT  32.56 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0275  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.6 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0661  flagellar biosynthesis repressor FlbT  35.54 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.262146 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4189  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.27 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1040  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.27 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1135  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.27 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.405413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6510  flagellar biosynthesis repressor FlbT  33.88 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0687  flagellar FlbT family protein  32.81 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0957504  normal  0.147994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1672  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.25 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1335  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.37 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0687  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.68 
 
 		 173 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3799  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.47 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0698  flagellar biosynthesis repressor FlbT  34.68 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0280  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.35 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1103  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.37 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.268385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2550  flagellar FlbT family protein  29.13 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1118  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.81 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3334  flagellar FlbT family protein  30 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1492  flagellar FlbT family protein  31.78 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1195  flagellar FlbT family protein  30 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3553  flagellar biosynthesis repressor FlbT  29.46 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.646501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1409  flagellar FlbT family protein  30.77 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1248  flagellar FlbT family protein  30.77 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3744  flagellar FlbT family protein  27.07 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3828  flagellar FlbT family protein  29.32 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0340484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0523  flagellar biosynthesis repressor FlbT  31.45 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0107  flagellar biosynthesis regulator FlbT-like protein  32.56 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5763  flagellar FlbT family protein  32.09 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0342  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.23 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463686  normal  0.484811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0374  flagellar biosynthesis repressor FlbT  28.23 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2857  flagellar FlbT  24.41 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.920076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5400  flagellar FlbT family protein  30.89 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5529  flagellar biosynthesis repressor FlbT  30.36 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0046  flagellar biosynthesis repressor FlbT  24.79 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>