67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1953 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1959  hypothetical protein  77.75 
 
 		 475 aa  773    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1953  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  987    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.67 
 
 		 821 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  27.34 
 
 		 553 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  28.67 
 
 		 784 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.61 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.17 
 
 		 818 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.94 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  26.27 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  25.79 
 
 		 792 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  27.18 
 
 		 560 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.28 
 
 		 561 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.4 
 
 		 563 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  31.85 
 
 		 569 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  25 
 
 		 776 aa  67  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  26.24 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  27.66 
 
 		 551 aa  63.9  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.05 
 
 		 1919 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  30.39 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.07 
 
 		 570 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.35 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  25.83 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  30.81 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.65 
 
 		 837 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  27.82 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  27.13 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  24.36 
 
 		 643 aa  58.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  26.88 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.07 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  27.8 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  25.64 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.61 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  32.02 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  27 
 
 		 449 aa  54.3  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.32 
 
 		 1679 aa  53.9  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.26 
 
 		 469 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  26.53 
 
 		 714 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.63 
 
 		 1147 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  28.42 
 
 		 577 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  27.32 
 
 		 743 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.99 
 
 		 555 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  26.09 
 
 		 911 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.81 
 
 		 553 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  26.44 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.86 
 
 		 706 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.77 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.14 
 
 		 1848 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  21.98 
 
 		 787 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  26.38 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  26.38 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  26.98 
 
 		 554 aa  50.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  25.88 
 
 		 566 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_6750  predicted protein  30.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0046022  normal  0.726599 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.27 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.96 
 
 		 717 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  28.16 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  27.71 
 
 		 728 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  25 
 
 		 1207 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  27.87 
 
 		 389 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  26.86 
 
 		 643 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  29.34 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.67 
 
 		 737 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.57 
 
 		 209 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  24.86 
 
 		 1129 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51473  predicted protein  30.34 
 
 		 1448 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  29.14 
 
 		 1222 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>