More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2840 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2927  ABC transporter related  99.15 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.676713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1429  putative amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.15 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2840  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 236 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1316  ABC transporter-related protein  66.81 
 
 		 236 aa  328  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000226028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2997  ABC transporter related  48.94 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  48.75 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1270  ABC transporter related  49.35 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000211424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  48.09 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.15 
 
 		 231 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  45.11 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  45.11 
 
 		 231 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.09 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.38 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.23 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.45 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.81 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.64 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.09 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  45.61 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  45.96 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  45.96 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 		 230 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  45.91 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.38 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  45.96 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.96 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  42.37 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  46.82 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  47.06 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  46.4 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  43.29 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.92 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.66 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.05 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  43.53 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  43.4 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.55 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 		 232 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.24 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.06 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.79 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  42.86 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.79 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1957  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  42.34 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  40.51 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  42.79 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  43.24 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  43.24 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.89 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  42.62 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.02 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  42.86 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.89 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.47 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.98 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.44 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  40.71 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  40.76 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2246  ATPase  41.18 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  37.39 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.87 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1285  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.3 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.96 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.45 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  38.72 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.87 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  39.57 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  37.45 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  37.45 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.82 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.38 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2616  ATPase  42.02 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0328199  normal  0.247142 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29701  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  40.76 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.3 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08841  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  39.92 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.87 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.87 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  36.6 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  39.21 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>