198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2616 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2616  transposase  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  64.47 
 
 		 243 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  65.38 
 
 		 212 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  65.38 
 
 		 238 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  67.57 
 
 		 238 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  58.82 
 
 		 263 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  58.82 
 
 		 341 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  65.28 
 
 		 181 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  63.89 
 
 		 206 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  58.33 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  58.33 
 
 		 228 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  63.89 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  63.89 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  55.56 
 
 		 228 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  55.56 
 
 		 228 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  62.5 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  62.5 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  62.5 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  62.5 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  51.14 
 
 		 202 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  48.86 
 
 		 235 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  48.28 
 
 		 235 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  48.28 
 
 		 235 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  48.86 
 
 		 198 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  54.67 
 
 		 236 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  54.17 
 
 		 228 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  45.98 
 
 		 222 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  45.98 
 
 		 235 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.32 
 
 		 319 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  54.29 
 
 		 250 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  49.38 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  51.43 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  55.38 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  48.68 
 
 		 250 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  48.68 
 
 		 250 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  50.68 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  50 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  40.54 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  50.7 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  50.7 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  50.7 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  50.7 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  42.7 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  42.7 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  55.74 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  55.74 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  55.74 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  48.57 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 		 346 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  52.11 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  47.06 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  55.74 
 
 		 213 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  55.74 
 
 		 228 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  48.57 
 
 		 250 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  47.06 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  42.7 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  42.7 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  47.14 
 
 		 250 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  45.21 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  45.21 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  45.21 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  45.59 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  45.59 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  50 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  46.58 
 
 		 226 aa  72  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  46.58 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  42.7 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  44.71 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  50 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  44.93 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  44.93 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  39.33 
 
 		 234 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  39.33 
 
 		 240 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  46.25 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  54.1 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  50 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>