46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2201 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  95.87 
 
 
1480 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  70.75 
 
 
999 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  74.67 
 
 
1499 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  65.71 
 
 
940 aa  94.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  58.14 
 
 
1789 aa  93.2  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  66.18 
 
 
435 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  63.24 
 
 
1814 aa  84  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  63.24 
 
 
2107 aa  83.2  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  62.3 
 
 
3598 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  55.22 
 
 
1112 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  54.69 
 
 
959 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  56.14 
 
 
4687 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  46.55 
 
 
677 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  31.19 
 
 
466 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  47.37 
 
 
320 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08930  hypothetical protein  31.43 
 
 
380 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  46.55 
 
 
928 aa  55.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  48.61 
 
 
326 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  46.55 
 
 
532 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  47.06 
 
 
1607 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  44.07 
 
 
1809 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  39.74 
 
 
1415 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  39.74 
 
 
682 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1835  hypothetical protein  40.62 
 
 
230 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.0657358 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  38.46 
 
 
1216 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  38.46 
 
 
1200 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  38.46 
 
 
586 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  43.86 
 
 
428 aa  48.9  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  40.35 
 
 
618 aa  48.9  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  43.86 
 
 
548 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  41.38 
 
 
354 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  45.28 
 
 
2296 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  47.17 
 
 
1544 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  42.11 
 
 
541 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  42.86 
 
 
422 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  40.35 
 
 
844 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.14 
 
 
1925 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  44.44 
 
 
2682 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4738  hypothetical protein  38.3 
 
 
383 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000391664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  42.11 
 
 
4798 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  37.5 
 
 
585 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  40 
 
 
359 aa  42.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  36.99 
 
 
582 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  44.07 
 
 
327 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  40.35 
 
 
679 aa  42.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>