More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2210 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
851 aa  1562    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  42.78 
 
 
888 aa  452  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  35.15 
 
 
826 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.03 
 
 
837 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  37.48 
 
 
798 aa  295  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.29 
 
 
772 aa  267  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.15 
 
 
790 aa  266  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  35.12 
 
 
819 aa  254  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  35.88 
 
 
829 aa  238  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  36.2 
 
 
787 aa  233  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.12 
 
 
812 aa  232  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  37.77 
 
 
867 aa  218  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  43.64 
 
 
821 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  46.1 
 
 
516 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  50 
 
 
800 aa  179  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.12 
 
 
778 aa  178  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.88 
 
 
794 aa  177  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  50.56 
 
 
502 aa  177  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7076  beta-lactamase domain protein  37.7 
 
 
363 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.666758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  44.57 
 
 
656 aa  165  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.32 
 
 
818 aa  164  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  38.19 
 
 
559 aa  162  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  42.86 
 
 
710 aa  160  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.88 
 
 
806 aa  157  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.24 
 
 
757 aa  157  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  41.87 
 
 
784 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  41.39 
 
 
806 aa  154  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  41.31 
 
 
872 aa  154  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.83 
 
 
795 aa  146  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.81 
 
 
859 aa  145  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  27.5 
 
 
872 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.96 
 
 
786 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.61 
 
 
795 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.54 
 
 
761 aa  137  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.01 
 
 
773 aa  137  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.16 
 
 
789 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.81 
 
 
796 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  39.78 
 
 
781 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.41 
 
 
780 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  35.85 
 
 
474 aa  135  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.7 
 
 
770 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.69 
 
 
792 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.29 
 
 
773 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.01 
 
 
773 aa  134  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  38.06 
 
 
514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  42.13 
 
 
489 aa  128  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.84 
 
 
773 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.79 
 
 
775 aa  124  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  22.68 
 
 
773 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.32 
 
 
896 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.38 
 
 
814 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  44.23 
 
 
519 aa  112  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  26.19 
 
 
443 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.28 
 
 
809 aa  109  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  29.91 
 
 
562 aa  109  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1235  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
295 aa  105  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000521991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3555  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
300 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000166822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  34.45 
 
 
514 aa  104  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.28 
 
 
752 aa  104  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  25.6 
 
 
454 aa  100  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2771  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
367 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4309  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 
451 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.115113  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.18 
 
 
860 aa  98.2  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.51 
 
 
750 aa  97.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.17 
 
 
778 aa  95.5  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2092  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  33.59 
 
 
331 aa  95.9  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.214294  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  26.26 
 
 
461 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  44.91 
 
 
488 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.77 
 
 
773 aa  94.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  26.2 
 
 
461 aa  94  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.89 
 
 
781 aa  92.8  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  31.95 
 
 
531 aa  92.8  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  26.2 
 
 
461 aa  93.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2832  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.04 
 
 
772 aa  92.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395271  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.9 
 
 
749 aa  91.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1520  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  27.87 
 
 
746 aa  91.3  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  26.75 
 
 
733 aa  91.3  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.94 
 
 
734 aa  90.9  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.43 
 
 
791 aa  90.5  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 
320 aa  90.5  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  25.83 
 
 
461 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  25.83 
 
 
461 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0782  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.05 
 
 
745 aa  89.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1910  metallo-beta-lactamase family protein  24.45 
 
 
284 aa  89.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.404298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.52 
 
 
654 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.52 
 
 
773 aa  89  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  37.75 
 
 
524 aa  88.6  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1155  competence protein ComEC/Rec2, putative  20.61 
 
 
738 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  26.33 
 
 
843 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.47 
 
 
682 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1314  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
363 aa  86.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.43 
 
 
840 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.55 
 
 
808 aa  85.5  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.62 
 
 
802 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  20.86 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  25.82 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  42.72 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  42.72 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  26.14 
 
 
734 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1849  metallo-beta-lactamase family protein  27.27 
 
 
286 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000969274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>