290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1791 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1904  Ferritin Dps family protein  81.29 
 
 
190 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18630  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  74.73 
 
 
191 aa  280  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284161  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1159  Ferritin Dps family protein  66.48 
 
 
199 aa  260  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.385489  normal  0.0464368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18820  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  64.81 
 
 
216 aa  220  7e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000855963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  59.66 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  59.66 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  59.66 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  59.65 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  60.37 
 
 
182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0218  Ferritin Dps family protein  59.06 
 
 
182 aa  210  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0902  Ferritin Dps family protein  58.93 
 
 
187 aa  202  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02269  stress response DNA-binding protein Dps  56.79 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  58.44 
 
 
163 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1410  DNA-binding ferritin-like protein  48.05 
 
 
159 aa  148  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0013  ferritin-like protein  48.37 
 
 
159 aa  142  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000373945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  36.99 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.22 
 
 
167 aa  85.1  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0545  Ferritin Dps family protein  37.84 
 
 
157 aa  85.1  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.06 
 
 
167 aa  84.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3536  Ferritin and Dps  36.57 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.196508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.59 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  34.69 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0470  Ferritin Dps family protein  34.23 
 
 
159 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  34.03 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.77 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  34.01 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  37.09 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  39.84 
 
 
167 aa  79  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  37.68 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  35.17 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.16 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.16 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1209  Ferritin Dps family protein  34.25 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  37.16 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.8 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.82 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.82 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.82 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.82 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  33.12 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  31.82 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.77 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  37.59 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0761  Ferritin, Dps family protein  30.2 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.48 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  36.48 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.59 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0878  Ferritin Dps family protein  30.87 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  31.55 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4823  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  28.93 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  35.43 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.67 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  35.9 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1175  Ferritin Dps family protein  37.29 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209893  normal  0.0519579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  30.06 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3319  putative DNA-binding protein  34.23 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2394  ferritin-like domain-containing protein  34.23 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2580  ferritin-like domain-containing protein  34.23 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1171  ferritin-like domain-containing protein  34.23 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0310  ferritin-like domain-containing protein  34.23 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3353  ferritin-like domain-containing protein  34.23 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.27996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3364  DpsA  34.23 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6797  putative DNA-binding stress protein (oxydative damage protectant)  32.9 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2744  ferritin Dps family protein  31.67 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  33.86 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  30.67 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  34.67 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  32.5 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  33.56 
 
 
162 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  35.57 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  35.48 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  33.56 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0644  Ferritin Dps family protein  33.56 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0618  Ferritin, Dps family protein  33.56 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  31.79 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0244  Ferritin and Dps  35.43 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0696  Ferritin Dps family protein  35.43 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134287  normal  0.270439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0728  Ferritin, Dps family protein  35.43 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4105  Ferritin Dps family protein  36.3 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4066  Ferritin Dps family protein  36.3 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3741  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  32.89 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81724  normal  0.0592077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  32.85 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  32.85 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  32.21 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  26.99 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2804  Ferritin and Dps  30.87 
 
 
161 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3302  Ferritin Dps family protein  32 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00440191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>