More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0958 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
506 aa  986    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.26 
 
 
510 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348427  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.94 
 
 
506 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.122029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2826  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.83 
 
 
513 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.392929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7204  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems permease components-like protein  46.53 
 
 
502 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26200  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  47.38 
 
 
505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.59 
 
 
505 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 
507 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15560  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  44.92 
 
 
506 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.031128  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4534  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
336 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.73 
 
 
322 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  46.06 
 
 
321 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  46.06 
 
 
321 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
332 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
355 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31130  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.75 
 
 
338 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
325 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161114  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.59 
 
 
331 aa  144  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
321 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
334 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11309  oligopeptide-transport integral membrane protein ABC transporter oppB  43.87 
 
 
325 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  47.55 
 
 
333 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  48.65 
 
 
339 aa  140  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  48.65 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  46.43 
 
 
339 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.33 
 
 
336 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.22 
 
 
325 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 
321 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.37 
 
 
322 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  49.32 
 
 
339 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
325 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
325 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 
327 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
325 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1632  putative ABC transporter permease  44.05 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214794  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.11 
 
 
324 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  47.3 
 
 
339 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.41 
 
 
319 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  48.65 
 
 
339 aa  136  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 
334 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  47.3 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  47.3 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  46.62 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  47.3 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  46.62 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  46.62 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
326 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.109225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  46.62 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  47.3 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  47.3 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  48.65 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  46.62 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  47.3 
 
 
381 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  47.3 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  47.3 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  47.3 
 
 
339 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 
334 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  51.45 
 
 
324 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
313 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.41 
 
 
318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.6 
 
 
317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.58 
 
 
326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0131  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.1 
 
 
326 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
313 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5137  putative peptide ABC transporter protein, permease protein  44.44 
 
 
339 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0417349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  50.36 
 
 
339 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  50.36 
 
 
339 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  50 
 
 
336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  50.75 
 
 
336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  0.026678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.88 
 
 
325 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  50 
 
 
336 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  50.37 
 
 
336 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  50.37 
 
 
336 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
336 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
336 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
336 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  50.37 
 
 
337 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  50 
 
 
336 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3302  dipeptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
338 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
338 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0246  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.32 
 
 
307 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0244  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  50 
 
 
336 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2970  dipeptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
338 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
338 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0257  dipeptide ABC transporter, permease protein DppB  50 
 
 
336 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0183254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0438  dipeptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
336 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5079  oligopeptide ABC transporter, permease protein  46.32 
 
 
318 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823719  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.28 
 
 
326 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  44.93 
 
 
313 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  50 
 
 
326 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1527  nickel-transporting ATPase  46.1 
 
 
338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
318 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.75 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186843  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>