More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0434 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0434  ABC transporter related protein  100 
 
 
291 aa  556  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  72.1 
 
 
247 aa  292  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3281  ABC transporter related  68.62 
 
 
261 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6405  ABC transporter related  64.53 
 
 
249 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0333973  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  66.38 
 
 
259 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4520  ABC transporter related  62.29 
 
 
249 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.719426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2980  ABC transporter related protein  62.9 
 
 
255 aa  259  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29410  ABC transporter, ATP binding component  60.74 
 
 
250 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0723  ABC transporter related  61.97 
 
 
251 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00967662  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2637  ABC sulfonate transporter, ATPase subunit  60.26 
 
 
247 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.327484  hitchhiker  0.00000882208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0249  ABC transporter related  56.63 
 
 
302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1379  ABC transporter-like protein  61.6 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.279047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3158  ABC transporter related  61.83 
 
 
245 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4418  ABC transporter related  55.74 
 
 
241 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.05 
 
 
247 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21610  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP binding component  58.37 
 
 
266 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2658  ABC transporter related  54.83 
 
 
271 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  64.19 
 
 
226 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4107  ABC transporter related  56.11 
 
 
242 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2621  ABC transporter related  61.54 
 
 
245 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.585434  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0465  ABC transporter related protein  59.05 
 
 
244 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3465  ABC transporter related  60.62 
 
 
241 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1797  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.62 
 
 
270 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2582  ABC transporter related  61.11 
 
 
245 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2627  ABC transporter related  61.11 
 
 
245 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0950652  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0424  ABC transporter related protein  57.63 
 
 
254 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.573696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3597  ABC transporter  56.78 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  59.49 
 
 
261 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3399  ABC transporter related protein  56.97 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7802  ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 
237 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3817  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
249 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2973  ABC transporter related  52.83 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.493702  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2416  ABC transporter related  54.09 
 
 
270 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.769125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3479  ABC transporter related protein  53.47 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3298  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  58.72 
 
 
239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4339  ABC transporter related  53.72 
 
 
252 aa  195  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.764562  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4636  ABC transporter related  52.61 
 
 
326 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214467  hitchhiker  0.0000194183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1735  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.32 
 
 
257 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3412  ABC transporter-related protein  52.99 
 
 
250 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0308441  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0766  ABC transporter related  51.32 
 
 
253 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  47.84 
 
 
255 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1775  ABC transporter related  50.93 
 
 
278 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.72 
 
 
271 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.72 
 
 
271 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2227  ABC transporter related protein  52.91 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0741245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1868  ABC transporter ATP-binding protein  51.08 
 
 
288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  50.22 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0424  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.29 
 
 
271 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  51.83 
 
 
299 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0117  ATPase  54.82 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182044  hitchhiker  0.000782511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  49.56 
 
 
333 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0023  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.33 
 
 
266 aa  188  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19580  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.58 
 
 
274 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2491  ABC aliphatic sulfonates transporter, ATPase subunit  50.44 
 
 
261 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5314  aliphatic sulfonates ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 
270 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1685  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.31 
 
 
274 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4874  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.12 
 
 
270 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0029  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  48.88 
 
 
266 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.05113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3873  ABC transporter related  58.37 
 
 
289 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195534  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5411  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.86 
 
 
268 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125743  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1373  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 
291 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3041  ABC transporter-related protein  53.02 
 
 
272 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.0417825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1280  ABC transporter related  52.27 
 
 
279 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161997  normal  0.0814876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2436  ABC transporter related  49.77 
 
 
277 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30480  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.86 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2186  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.03 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0564256  normal  0.601575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1217  ABC transporter related  51.82 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.216616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1341  aliphatic sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  53.7 
 
 
284 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120657  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.19 
 
 
256 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1375  ABC transporter related protein  52.24 
 
 
258 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.239653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3412  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  49.07 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4320  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  49.52 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  49.07 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5004  ABC transporter related  52.77 
 
 
245 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.472634  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  49.07 
 
 
318 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1641  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  45.74 
 
 
269 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1672  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.19 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  48.6 
 
 
319 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  48.6 
 
 
319 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0658  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  47.98 
 
 
263 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.29 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4972  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.88 
 
 
270 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243489  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  47.53 
 
 
263 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0240  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.19 
 
 
270 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10949  hitchhiker  0.000841582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0255  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.19 
 
 
270 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.213675  normal  0.0453993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2407  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.26 
 
 
245 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626164  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0264  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.19 
 
 
270 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2881  ABC transporter related  50.67 
 
 
280 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.542857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  49.34 
 
 
288 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2449  ABC transporter related  49.53 
 
 
255 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  47.09 
 
 
263 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5467  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (aliphatic sulfonate)  50.24 
 
 
275 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2710  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.35574  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0380  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.73 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.625066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1237  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.73 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1042  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  47.03 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1035  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  46.19 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0244681  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1723  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  50.73 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>