28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0382 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  45.82 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  41.7 
 
 
222 aa  125  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  41.96 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  42.08 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  28.31 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.31 
 
 
478 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.31 
 
 
1171 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.32 
 
 
1265 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2270  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.84 
 
 
1503 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  25.23 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  30 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  24.42 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  29.23 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  29.23 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  29.23 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  27.18 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  25.42 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  21.68 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  25.42 
 
 
213 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  26.36 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  24.34 
 
 
1194 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  27.88 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  27.97 
 
 
214 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  22.31 
 
 
314 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.22 
 
 
1180 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>