39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2853 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  200  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  47.56 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  43.9 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  48.24 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  45.16 
 
 
102 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  43.75 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  43.42 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  40.48 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  47.3 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  36.47 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  40.79 
 
 
93 aa  58.9  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  34.67 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  36 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  36 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  39.29 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  37.63 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  37.63 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  37.33 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  33.33 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  33.33 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  33.33 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  33.33 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  38.55 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  34.52 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  37.93 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  34.52 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  34.52 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  38.75 
 
 
95 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  36.67 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  39.47 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  30.67 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  35.9 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  35.9 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  32 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  26.97 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  32.56 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  34.48 
 
 
90 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>