79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1584 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1584  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  45.54 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  39.24 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  39.31 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0741  hypothetical protein  41.11 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2739  hypothetical protein  41.46 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1395  hypothetical protein  38.16 
 
 		 218 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2665  hypothetical protein  45.05 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.69 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.27 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.28 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.82 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.48 
 
 		 958 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.2 
 
 		 958 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.78 
 
 		 931 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.64 
 
 		 930 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.67 
 
 		 943 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.61 
 
 		 933 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.44 
 
 		 938 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  27.11 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.96 
 
 		 933 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.43 
 
 		 932 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.8 
 
 		 961 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.51 
 
 		 930 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2666  hypothetical protein  47.62 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1284  hypothetical protein  46.55 
 
 		 96 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01580  hypothetical protein  32.47 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.14 
 
 		 953 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.18 
 
 		 932 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.97 
 
 		 969 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.26 
 
 		 952 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.19 
 
 		 943 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2860  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.03 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.795872 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.79 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.16 
 
 		 971 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.43 
 
 		 933 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.18 
 
 		 971 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.18 
 
 		 971 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.18 
 
 		 971 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.92 
 
 		 966 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.21 
 
 		 967 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.11 
 
 		 931 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  29.07 
 
 		 891 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0683  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  31.25 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.39 
 
 		 959 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.58 
 
 		 980 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.33 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0887  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  34.73 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.389857  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.34 
 
 		 966 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0558  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  25.29 
 
 		 181 aa  46.6  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.71 
 
 		 233 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.44 
 
 		 969 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.09 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.95 
 
 		 972 aa  46.2  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  27.84 
 
 		 972 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.84 
 
 		 972 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.51 
 
 		 941 aa  45.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.95 
 
 		 970 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.23 
 
 		 931 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  38.61 
 
 		 980 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2970  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  33.55 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130344 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.32 
 
 		 964 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.86 
 
 		 983 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35 
 
 		 767 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1394  hypothetical protein  44.07 
 
 		 107 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0504  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  37.68 
 
 		 81 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000912266  hitchhiker  0.000130632 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.32 
 
 		 964 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.97 
 
 		 975 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2738  hypothetical protein  43.64 
 
 		 110 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.51828  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.7 
 
 		 962 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.34 
 
 		 800 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 		 948 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.34 
 
 		 800 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  29.95 
 
 		 964 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.1 
 
 		 981 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.12 
 
 		 975 aa  42.7  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  24.29 
 
 		 800 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.04 
 
 		 1006 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  27.92 
 
 		 889 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>