More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1080 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1080  signal recognition particle protein  100 
 
 		 447 aa  885    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0551  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.59 
 
 		 449 aa  585  1e-166  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0377255  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0475  signal recognition particle protein  64.59 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.221272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.05 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  49.08 
 
 		 504 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  50.81 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  49.88 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.96 
 
 		 491 aa  441  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1184  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.31 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 511 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3351  signal recognition particle protein  49.07 
 
 		 551 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.31296 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  48.94 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  47.75 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  48.85 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  48.85 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 523 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  48.6 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  50.47 
 
 		 523 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  47.34 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  46.42 
 
 		 449 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  49.88 
 
 		 511 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.06 
 
 		 515 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2983  signal recognition particle protein  49.41 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  48.71 
 
 		 505 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2154  signal recognition particle protein  48.67 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.995378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  44.98 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.71 
 
 		 505 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  47.61 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.66 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1077  signal recognition particle protein  51.76 
 
 		 523 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.624173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  47.62 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  48.71 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  48.16 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  48.02 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  47.79 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  47.79 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  48.02 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  48.02 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  46.77 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  48.37 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  47.79 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  48.02 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  47.79 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  48.84 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  46.77 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  48.25 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  47.79 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  48.02 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  46.92 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  49.07 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.05 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50 
 
 		 522 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0057  signal recognition particle protein  49.89 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.201387  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0047  signal recognition particle protein  50.11 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.47 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  48.17 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  45.96 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3095  signal recognition particle protein  50.24 
 
 		 514 aa  415  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  48.84 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1150  signal recognition particle protein  50.58 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  47.69 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0221  signal recognition particle protein  48.84 
 
 		 514 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115082  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  48.71 
 
 		 522 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  48.71 
 
 		 498 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3275  signal recognition particle protein  47.02 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0976333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  50 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4203  signal recognition particle protein  49.29 
 
 		 526 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0353  signal recognition particle protein  48.38 
 
 		 514 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  48.72 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  45.92 
 
 		 508 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0510  signal recognition particle protein  48.38 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  47.93 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  48.72 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  48.01 
 
 		 526 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  47.14 
 
 		 515 aa  410  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  46.05 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  46.26 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  47.02 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0176  signal recognition particle protein  48.24 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0246  signal recognition particle protein  48.61 
 
 		 516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.58 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  46.74 
 
 		 492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1464  signal recognition particle protein  48.03 
 
 		 513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.517812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.75 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  44.99 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  47.09 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  48.39 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.81 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  48.61 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.86 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  47.27 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  48.47 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  48.47 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  48.24 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.14 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  47.78 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  47.78 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  48.24 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  48.24 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>