More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2078 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2078  ABC transporter related  100 
 
 		 503 aa  1008    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  55.69 
 
 		 506 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  51.74 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.96 
 
 		 503 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  45.62 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  44.96 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  42.8 
 
 		 492 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  44.47 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.51 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.97 
 
 		 499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.97 
 
 		 499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  44.1 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  44.9 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.02 
 
 		 520 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.2 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  45.24 
 
 		 519 aa  405  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.05 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  47.05 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  45.72 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  44.85 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  42.39 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  42.69 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.57 
 
 		 520 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  45.42 
 
 		 506 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 510 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  42.05 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  42.22 
 
 		 492 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  41.57 
 
 		 509 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  42.97 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.6 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  43.86 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  39.11 
 
 		 501 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  41.21 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  42.16 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  45.55 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  41.01 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  42.83 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  41.01 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.06 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.97 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  45.03 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.6 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 512 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  44.27 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  44.38 
 
 		 498 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.06 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  42.48 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 507 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  41.18 
 
 		 494 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 504 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  42.89 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.68 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  43.21 
 
 		 508 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42.26 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.13 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.65 
 
 		 524 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.81 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  43.04 
 
 		 524 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.65 
 
 		 524 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.81 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43.35 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.81 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  45.03 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.84 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.28 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  41.46 
 
 		 518 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.06 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  41.67 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 522 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2258  ABC transporter related  44.13 
 
 		 492 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0621772  normal  0.0357164 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.79 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.04 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.42 
 
 		 512 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  41.5 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.8 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.05 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.42 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.44 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.42 
 
 		 512 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  41.26 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  40.78 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.63 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  41.37 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.86 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.44 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  40.49 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>