80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1590 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
144 aa  300  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  54.35 
 
 
147 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  55.97 
 
 
147 aa  160  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  50.35 
 
 
143 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  50.35 
 
 
143 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  56 
 
 
147 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  54.96 
 
 
136 aa  146  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  43.61 
 
 
152 aa  120  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 
140 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  42.42 
 
 
148 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
132 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.39 
 
 
145 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
145 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  27.34 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  29.63 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  24.81 
 
 
314 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
138 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
129 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  27.01 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  26.56 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  23.21 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  28.57 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  25.26 
 
 
139 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
142 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  29.89 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.88 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0557  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  24.59 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  29.57 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  22.76 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1875  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1849  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0817  thioesterase family protein  26.96 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  22.14 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  24.14 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  25.64 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.64 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  25 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1045  thioesterase family protein  26.61 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0988  thioesterase family protein  26.61 
 
 
124 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0576476  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  24.73 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2435  hypothetical protein  28.57 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131959  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  20.9 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  23.02 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.89 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.52 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.77 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.6 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4064  thioesterase superfamily protein  29.11 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000508078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  24.69 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  23.39 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  24.69 
 
 
136 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  24.69 
 
 
136 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>