More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4406 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4406  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 589 aa  1190    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.277319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0264  acyl-CoA dehydrogenase-like  68.06 
 
 		 569 aa  765    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3118  acyl-CoA dehydrogenase-like  71.03 
 
 		 575 aa  779    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.042843  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.22 
 
 		 563 aa  715    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14270  acyl-CoA dehydrogenase  51.22 
 
 		 585 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  48.42 
 
 		 595 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2404  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.7 
 
 		 581 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2051  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.96 
 
 		 582 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  0.942384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.3 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.85 
 
 		 595 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.48 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.85 
 
 		 595 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.48 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.85 
 
 		 595 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.85 
 
 		 595 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0987  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.9 
 
 		 597 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.48 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.48 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.69 
 
 		 595 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.49 
 
 		 595 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.28 
 
 		 595 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.11 
 
 		 595 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.28 
 
 		 595 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.28 
 
 		 595 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3354  acyl-CoA dehydrogenase, ferrulic acid biotransformation protein, putative  48.45 
 
 		 584 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.47 
 
 		 595 aa  482  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.28 
 
 		 599 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  46.14 
 
 		 595 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  47.11 
 
 		 595 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.77 
 
 		 595 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.93 
 
 		 595 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.79 
 
 		 595 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2761  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.75 
 
 		 596 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  46.78 
 
 		 596 aa  465  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3477  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.95 
 
 		 598 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.91 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.99 
 
 		 598 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  44.22 
 
 		 598 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3101  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.79 
 
 		 592 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.27 
 
 		 598 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0105  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.8 
 
 		 612 aa  451  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0571  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.59 
 
 		 598 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.24 
 
 		 596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.22 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.12 
 
 		 598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.33 
 
 		 597 aa  443  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25210  acyl-CoA dehydrogenase  46.78 
 
 		 591 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.885326  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.16 
 
 		 601 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4445  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.54 
 
 		 626 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744679  normal  0.0140421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.16 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.71 
 
 		 594 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3270  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.57 
 
 		 589 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.928041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6066  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  45.62 
 
 		 598 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3693  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.57 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.58 
 
 		 594 aa  438  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.36 
 
 		 595 aa  439  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45 
 
 		 603 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.66 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.37 
 
 		 592 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.64 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  49.78 
 
 		 601 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.54 
 
 		 592 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.07 
 
 		 592 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.1 
 
 		 597 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.47 
 
 		 589 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2048  acyl-CoA dehydrogenase, putative  45.81 
 
 		 616 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.681425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.44 
 
 		 589 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.73 
 
 		 597 aa  430  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.1 
 
 		 595 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.79 
 
 		 593 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.67 
 
 		 601 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.1 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  43.27 
 
 		 596 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.97 
 
 		 592 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253086  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3519  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.83 
 
 		 598 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.03 
 
 		 592 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.26 
 
 		 592 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2220  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.25 
 
 		 594 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.26 
 
 		 592 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.88 
 
 		 601 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.03 
 
 		 592 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2665  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.05 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.755851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2768  acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.14 
 
 		 596 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.42 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2552  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.96 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0690519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.93 
 
 		 596 aa  429  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3132  acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.16 
 
 		 589 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0885  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.36 
 
 		 596 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.894915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.57 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.57 
 
 		 598 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0899  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.01 
 
 		 593 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183433  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.36 
 
 		 601 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.2 
 
 		 597 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1766  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.07 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439337  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.36 
 
 		 601 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.57 
 
 		 596 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0515  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.32 
 
 		 591 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4606  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.94 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.504166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0623  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.77 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02316  Acyl-CoA dehydrogenase  41.14 
 
 		 599 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>