More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4156 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  59.49 
 
 		 654 aa  764    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  59.34 
 
 		 654 aa  763    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  59.34 
 
 		 654 aa  764    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  56.94 
 
 		 727 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  59.49 
 
 		 654 aa  764    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  56.74 
 
 		 724 aa  712    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  61.56 
 
 		 669 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  55.58 
 
 		 766 aa  772    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  65.36 
 
 		 673 aa  807    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  55.64 
 
 		 691 aa  679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  62.86 
 
 		 655 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  59.34 
 
 		 654 aa  760    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  60.3 
 
 		 669 aa  771    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 684 aa  1376    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  57.62 
 
 		 697 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  59.49 
 
 		 652 aa  764    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  61.56 
 
 		 669 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  57.75 
 
 		 717 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  60.18 
 
 		 672 aa  762    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  59.49 
 
 		 654 aa  763    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  59.82 
 
 		 662 aa  756    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  56.74 
 
 		 724 aa  712    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  55.83 
 
 		 766 aa  768    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  56.46 
 
 		 715 aa  754    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  59.49 
 
 		 654 aa  764    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  65.93 
 
 		 671 aa  833    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  57.08 
 
 		 717 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  62.07 
 
 		 674 aa  799    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  59.61 
 
 		 652 aa  765    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  61.41 
 
 		 669 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  60.21 
 
 		 681 aa  785    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  61.56 
 
 		 669 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  61.26 
 
 		 669 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  49.85 
 
 		 682 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  47.84 
 
 		 729 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  48.05 
 
 		 732 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 		 707 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  72.26 
 
 		 750 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  72.52 
 
 		 761 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  72.61 
 
 		 744 aa  582  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  72.87 
 
 		 743 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 		 722 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 		 725 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  70.75 
 
 		 767 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  70.75 
 
 		 767 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  72.24 
 
 		 749 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  70.75 
 
 		 767 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  70.75 
 
 		 767 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  48.66 
 
 		 684 aa  571  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  72.25 
 
 		 762 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  72.25 
 
 		 765 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  72.25 
 
 		 765 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  45.99 
 
 		 758 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  49.64 
 
 		 710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  48.44 
 
 		 684 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  47.82 
 
 		 719 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  68.64 
 
 		 726 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  52.44 
 
 		 783 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  43.49 
 
 		 702 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  43.33 
 
 		 704 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  63.33 
 
 		 784 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 671 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  42.38 
 
 		 674 aa  498  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  60 
 
 		 709 aa  497  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 686 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 694 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  54.47 
 
 		 710 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 688 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 695 aa  478  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  42.1 
 
 		 677 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  58.1 
 
 		 625 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  58.88 
 
 		 639 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  40.62 
 
 		 720 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 		 724 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  58.85 
 
 		 664 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  47.99 
 
 		 728 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 		 724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 		 735 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 702 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  54.09 
 
 		 736 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  54.09 
 
 		 736 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 747 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  48.89 
 
 		 806 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  54.64 
 
 		 684 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 699 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  38.31 
 
 		 700 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 709 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 760 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36 
 
 		 774 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  56.29 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  37.52 
 
 		 705 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  48.16 
 
 		 662 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  35.01 
 
 		 770 aa  379  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 759 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  35.44 
 
 		 769 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  34.68 
 
 		 769 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  34.83 
 
 		 769 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  35.87 
 
 		 785 aa  378  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 		 871 aa  379  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 758 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>