253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4091 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 278 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  80 
 
 		 293 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  80.38 
 
 		 282 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  76.36 
 
 		 283 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  78.11 
 
 		 297 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  72.5 
 
 		 290 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  77.36 
 
 		 286 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  77.36 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.56 
 
 		 291 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  76.03 
 
 		 290 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  74.91 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  74.91 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  75.28 
 
 		 290 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  74.91 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  75.66 
 
 		 291 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  74.91 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  74.06 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.66 
 
 		 290 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.66 
 
 		 290 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.66 
 
 		 290 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  74.91 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.47 
 
 		 283 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  74.91 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  76.23 
 
 		 276 aa  407  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  74.91 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  74.91 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  74.91 
 
 		 290 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  78.26 
 
 		 283 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  70.74 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  71.54 
 
 		 296 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  74.13 
 
 		 303 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  70.37 
 
 		 293 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  70.37 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  71.54 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.23 
 
 		 291 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.87 
 
 		 287 aa  349  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  62.7 
 
 		 283 aa  314  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.43 
 
 		 276 aa  311  9e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.36 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  58.33 
 
 		 266 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  60.39 
 
 		 274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  52.92 
 
 		 304 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.92 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  51.97 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.97 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  54.05 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  54.37 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.67 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.62 
 
 		 284 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.62 
 
 		 295 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  53.17 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  52.76 
 
 		 272 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.92 
 
 		 275 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  52.59 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  50.57 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  51.39 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.57 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.36 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  51.57 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  53.54 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  50 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  49.62 
 
 		 266 aa  239  5e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.79 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.62 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.43 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  49.8 
 
 		 320 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.59 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  46.83 
 
 		 262 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.99 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  46.43 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  52.76 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.43 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  46.43 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  46.03 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.43 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.43 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.44 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.03 
 
 		 262 aa  224  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.03 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.03 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  45.21 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.84 
 
 		 262 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  48.79 
 
 		 263 aa  215  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  48.79 
 
 		 263 aa  215  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  51.74 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.18 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.76 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.92 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.6 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.9 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1790  segregation and condensation protein A  38.68 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1467  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.68 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  40.76 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  37.5 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.02 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.97 
 
 		 273 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  33.98 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  37.35 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>