176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1311 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 454 aa  917    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  71.74 
 
 		 454 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  71.24 
 
 		 454 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  68.67 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  65.64 
 
 		 458 aa  571  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  65.85 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  71.96 
 
 		 454 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  67.76 
 
 		 462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  63.35 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  63.35 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  63.76 
 
 		 449 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  66.29 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  65.32 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  65.32 
 
 		 464 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  69.93 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  61.56 
 
 		 459 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  60.79 
 
 		 457 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  58.28 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  69.1 
 
 		 359 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  46.15 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  38.62 
 
 		 451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  33.81 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  35.31 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  36.04 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  34.09 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  36.82 
 
 		 455 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  34.38 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  34.58 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  33.5 
 
 		 447 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.88 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  28.86 
 
 		 446 aa  189  7e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30.62 
 
 		 456 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  34.14 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  35.07 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  31.36 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  37.02 
 
 		 458 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.87 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  27.42 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  30.47 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.65 
 
 		 468 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.7 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.91 
 
 		 483 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  33.65 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  30.88 
 
 		 481 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  31.29 
 
 		 488 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  38.58 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  30.97 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.51 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  31.73 
 
 		 463 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  32.47 
 
 		 456 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.85 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.07 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.56 
 
 		 490 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  35.05 
 
 		 482 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  31.57 
 
 		 477 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.13 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  28.04 
 
 		 482 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.87 
 
 		 453 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.54 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  31.03 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  31.13 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.46 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  33.79 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  28.16 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  29.16 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  31.75 
 
 		 471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.36 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  31.57 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  31.46 
 
 		 503 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.12 
 
 		 469 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.02 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.23 
 
 		 503 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.23 
 
 		 503 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.67 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.84 
 
 		 463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.59 
 
 		 476 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  26.48 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  32.8 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  32.47 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  28.47 
 
 		 450 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  28.1 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  26.92 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.21 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  31.53 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  31.04 
 
 		 468 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  28.22 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  33.73 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.67 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  32.33 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  26.15 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  27.57 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  29.89 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  30.63 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  27.85 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  26.9 
 
 		 474 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  24.51 
 
 		 481 aa  113  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  27.47 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  27.47 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>