More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0248 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  100 
 
 
590 aa  1228    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  46.68 
 
 
589 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  47.5 
 
 
591 aa  525  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  41.27 
 
 
610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  42.44 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 
574 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 
577 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  37.32 
 
 
621 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  37.97 
 
 
580 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  37.81 
 
 
571 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  37.28 
 
 
571 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 
585 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 
586 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  36 
 
 
574 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  34.91 
 
 
606 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  35.03 
 
 
596 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  35.76 
 
 
579 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  35.68 
 
 
569 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
596 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  35.39 
 
 
569 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 
574 aa  363  6e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 
576 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
599 aa  359  9e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 
572 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
574 aa  351  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
576 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  31.06 
 
 
595 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  30.44 
 
 
563 aa  259  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  29.71 
 
 
571 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  30.78 
 
 
554 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  30.2 
 
 
553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  30.21 
 
 
529 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  28.42 
 
 
562 aa  236  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 
573 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  30.82 
 
 
559 aa  230  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 
548 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  29.29 
 
 
556 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 
555 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
566 aa  223  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  28.21 
 
 
556 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  27.51 
 
 
565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  30.04 
 
 
555 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  27.73 
 
 
556 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  28 
 
 
594 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  28.03 
 
 
580 aa  214  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  27.86 
 
 
556 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  29.83 
 
 
533 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  28.4 
 
 
582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 
700 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  26.45 
 
 
667 aa  193  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.4 
 
 
666 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  26.51 
 
 
705 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  31.88 
 
 
634 aa  117  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  29.93 
 
 
618 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.37 
 
 
627 aa  110  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
615 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 
479 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 
479 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 
466 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  27.24 
 
 
465 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  26.71 
 
 
325 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 
625 aa  109  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 
485 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
651 aa  107  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.54 
 
 
668 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
466 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 
328 aa  106  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
469 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  27.17 
 
 
614 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  26.8 
 
 
661 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.77 
 
 
650 aa  104  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
464 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  26.54 
 
 
486 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.71 
 
 
601 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
502 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  27.14 
 
 
662 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  27.9 
 
 
641 aa  100  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.17 
 
 
653 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
481 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  26.22 
 
 
481 aa  100  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.23 
 
 
728 aa  100  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.46 
 
 
594 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  29.06 
 
 
236 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
938 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  28.78 
 
 
636 aa  99  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
710 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.34 
 
 
693 aa  97.8  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.55 
 
 
916 aa  97.8  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.93 
 
 
715 aa  97.1  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.98 
 
 
863 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.11 
 
 
613 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
478 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  27.61 
 
 
399 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.24 
 
 
635 aa  96.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.03 
 
 
598 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  27.6 
 
 
625 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.71 
 
 
1023 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  24.3 
 
 
658 aa  96.3  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>