51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0268 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  789    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  74.93 
 
 		 382 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  77.12 
 
 		 388 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  74.29 
 
 		 388 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  74.55 
 
 		 388 aa  607  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  75.32 
 
 		 388 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  39.33 
 
 		 416 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  35.62 
 
 		 386 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  31.62 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  32.3 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  33.43 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  29.81 
 
 		 378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  32.29 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  28.69 
 
 		 408 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  29.66 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  25.95 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  30 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  27 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  27.57 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  24.63 
 
 		 358 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  25.72 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  26.01 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  25.97 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  26.27 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  30.15 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  29.94 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  21.87 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  27.88 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  22.87 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  23.5 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  21.04 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3276  hypothetical protein  26.03 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  24.45 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  26.28 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0764  hypothetical protein  30.09 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.798576  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  22.32 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  28.16 
 
 		 870 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  25.93 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  27.18 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.58 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  22.91 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00015  hypothetical protein  24.29 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  24.62 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  32.95 
 
 		 553 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  29.03 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  25.6 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  28.67 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  23.13 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  27.74 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  25.65 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4205  hypothetical protein  27.43 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000231794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>