37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03346 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03346  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  477  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06190  hypothetical protein  43.91 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0611  TPR repeat-containing protein  43.36 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0375  putative secretion system protein  33.03 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0542373  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0679  putative lipoprotein  26.22 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.185278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0596  putative lipoprotein  26.22 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0263  hypothetical protein  26.91 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000241482  hitchhiker  0.0000287047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.86 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 1252 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.11 
 
 		 557 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 		 1252 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.02 
 
 		 733 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 465 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  27.01 
 
 		 614 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  24.4 
 
 		 336 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 		 1073 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 409 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 409 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1178 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 748 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 870 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.34 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  26.72 
 
 		 299 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2402  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  30 
 
 		 477 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.79 
 
 		 391 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  25.19 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 860 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  19.3 
 
 		 518 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  22.62 
 
 		 503 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  23.17 
 
 		 369 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 586 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 827 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.96 
 
 		 882 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1137  Tetratricopeptide domain protein  26.58 
 
 		 375 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.451573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 542 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>