64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01423 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01423  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004038  membrane protein  83.33 
 
 		 183 aa  279  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.03896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1567  hypothetical protein  58.39 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.018833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2504  hypothetical protein  46.67 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2060  rhomboid family protein  47.4 
 
 		 204 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00283359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1915  rhomboid family protein  45.18 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2165  rhomboid family protein  46.25 
 
 		 201 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1853  rhomboid family protein  48.25 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2256  rhomboid family protein  45.73 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.18089  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4542  hypothetical protein  45.73 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2270  Rhomboid family protein  45.73 
 
 		 198 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00653341  normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2016  rhomboid-like protein  44.97 
 
 		 218 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2114  rhomboid family protein  47.37 
 
 		 198 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2350  rhomboid family protein  42.76 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0538538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2160  rhomboid family protein  48.25 
 
 		 198 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2553  rhomboid family protein  46.81 
 
 		 202 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0621154  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1088  integral membrane protein  44.37 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2063  rhomboid family protein  48.34 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2047  rhomboid family protein  44.38 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285623  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1875  rhomboid family protein  41.25 
 
 		 209 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1827  hypothetical protein  42.94 
 
 		 205 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.545159  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0888  rhomboid family protein  37.75 
 
 		 186 aa  97.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.86404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02194  membrane protein, Rhomboid family  39.87 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.411202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0230  membrane protein, rhomboid family  41.5 
 
 		 193 aa  87.8  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2522  rhomboid family membrane protein  41.29 
 
 		 195 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2148  rhomboid family membrane protein  41.55 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0169  Rhomboid family protein  39.86 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3112  rhomboid family protein  32.68 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  29.08 
 
 		 487 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  29.08 
 
 		 487 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 541 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  31.4 
 
 		 515 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 547 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 541 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  28.77 
 
 		 205 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  36.96 
 
 		 523 aa  51.2  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2486  hypothetical protein  32.21 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 298 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2892  putative transmembrane protein  33.11 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1467  hypothetical protein  29.58 
 
 		 211 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1085  Rhomboid family protein  29.33 
 
 		 204 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  28 
 
 		 327 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  30.12 
 
 		 486 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  27.74 
 
 		 342 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  26.49 
 
 		 569 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3791  rhomboid family protein  38.75 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  26.62 
 
 		 356 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13471  hypothetical protein  26 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  26.39 
 
 		 519 aa  42.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  27.74 
 
 		 342 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  26.54 
 
 		 182 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  29.46 
 
 		 242 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  25.35 
 
 		 554 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  28.78 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  31.82 
 
 		 274 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  27.67 
 
 		 513 aa  41.2  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 386 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  32.95 
 
 		 292 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  37.04 
 
 		 389 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1687  rhomboid-like protein  34.88 
 
 		 290 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205514  normal  0.563357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1033  rhomboid-like protein  28.28 
 
 		 198 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4990  peptidase S54-type, rhomboid-like protein  29.17 
 
 		 220 aa  40.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25145  normal  0.208438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  34.57 
 
 		 224 aa  40.4  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  29.41 
 
 		 228 aa  40.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>