More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003978 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003978  pyruvate formate-lyase activating enzyme  100 
 
 
246 aa  517  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1460  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  86.59 
 
 
246 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1953  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  84.02 
 
 
245 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01544  pyruvate formate-lyase 1 activating enzyme  91.16 
 
 
215 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1996  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  72.36 
 
 
246 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1728  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  72.76 
 
 
246 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  70.73 
 
 
246 aa  384  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1701  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  71.54 
 
 
246 aa  384  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2591  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  73.55 
 
 
244 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1618  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  73.55 
 
 
244 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344326  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2679  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  73.55 
 
 
265 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00906  pyruvate formate lyase activating enzyme 1  70.33 
 
 
246 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.84876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2741  pyruvate formate-lyase activating enzyme  70.33 
 
 
246 aa  380  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1063  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  70.33 
 
 
246 aa  380  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  71.49 
 
 
265 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2426  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  70.33 
 
 
255 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0764987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  70.33 
 
 
246 aa  380  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  71.49 
 
 
265 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2346  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  70.73 
 
 
246 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  71.49 
 
 
265 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  71.49 
 
 
265 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  70.33 
 
 
246 aa  380  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1008  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  70.33 
 
 
246 aa  380  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.312248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  71.49 
 
 
265 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  70.73 
 
 
246 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.542279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  70.2 
 
 
265 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2245  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  68.29 
 
 
246 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1147  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  68.7 
 
 
246 aa  353  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.223371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3308  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.63 
 
 
246 aa  346  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.760643  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2379  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  65.85 
 
 
246 aa  345  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0648375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1707  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.63 
 
 
246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1497  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.23 
 
 
246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2913  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  65.45 
 
 
246 aa  342  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1560  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  65.04 
 
 
246 aa  340  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0861855  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1493  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.63 
 
 
246 aa  340  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0621061  normal  0.601453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1671  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.41 
 
 
246 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1554  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  65.04 
 
 
246 aa  340  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.202343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2884  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.23 
 
 
246 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2672  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.23 
 
 
246 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.209524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2691  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.23 
 
 
246 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00335137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2770  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.23 
 
 
246 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.789492  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1693  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  64.23 
 
 
246 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2391  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  63.41 
 
 
246 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227753  normal  0.208715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2474  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  61.48 
 
 
245 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2407  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  60.66 
 
 
245 aa  315  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  51.9 
 
 
249 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50.84 
 
 
238 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  50.63 
 
 
243 aa  263  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  50.21 
 
 
243 aa  262  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50.42 
 
 
240 aa  261  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  50.21 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  50.21 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50.63 
 
 
243 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  50.21 
 
 
243 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  49.37 
 
 
243 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  49.37 
 
 
243 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  49.79 
 
 
243 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  49.37 
 
 
243 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23160  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50.21 
 
 
247 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  48.96 
 
 
243 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  48.48 
 
 
235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1999  pyruvate-formate lyase activating enzyme  50.21 
 
 
263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  48.48 
 
 
235 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1605  pyruvate-formate lyase activating enzyme  48.76 
 
 
266 aa  234  7e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2820  pyruvate formate-lyase activating enzyme  50 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1398  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  50.42 
 
 
262 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2365  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  50.21 
 
 
251 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2837  pyruvate formate-lyase activating enzyme  47.26 
 
 
255 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.128251 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0297  pyruvate formate-lyase activating enzyme  44.77 
 
 
247 aa  221  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0038  pyruvate formate-lyase activating enzyme  44.93 
 
 
229 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0217  pyruvate formate-lyase activating enzyme  49.35 
 
 
251 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0211  pyruvate formate-lyase activating enzyme  49.35 
 
 
251 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2719  pyruvate formate-lyase activating enzyme  46.89 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1542  pyruvate formate-lyase activating enzyme  43.22 
 
 
259 aa  215  7e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00863407  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16340  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  42.24 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243728  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2097  radical SAM family protein  45.06 
 
 
264 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1722  pyruvate formate-lyase activating enzyme  41.56 
 
 
293 aa  206  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461343  normal  0.162758 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0885  pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme  40.42 
 
 
293 aa  205  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2417  pyruvate formate-lyase activating enzyme  43.22 
 
 
281 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000163232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1081  pyruvate formate-lyase activating  42.37 
 
 
267 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257983  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2981  pyruvate formate-lyase activating  42.37 
 
 
267 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.743712  normal  0.290746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0692  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  40.42 
 
 
293 aa  201  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.104164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2999  radical SAM family protein  41.06 
 
 
265 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1049  pyruvate formate lyase activating enzyme  38.52 
 
 
246 aa  197  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0890  pyruvate formate-lyase activating  38.49 
 
 
275 aa  195  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.999298  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0654  pyruvate formate-lyase activating enzyme  45.09 
 
 
260 aa  193  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00347583  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1894  pyruvate formate-lyase activating enzyme  37.96 
 
 
334 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3207  pyruvate formate-lyase activating enzyme  39.08 
 
 
267 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000377553  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1397  pyruvate formate-lyase activating enzyme  40 
 
 
310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.559642 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1175  glycyl-radical activating family protein  33.46 
 
 
263 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0579151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  36.92 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2966  glycyl-radical activating family protein  31.97 
 
 
297 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36094  predicted protein  33.86 
 
 
324 aa  140  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0325  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  33.07 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.719518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1938  glycyl-radical enzyme activating protein family  31.89 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.239617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4091  glycyl-radical enzyme activating protein family  34.21 
 
 
305 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3054  radical-activating enzyme  30.2 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.969131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1247  glycyl-radical enzyme activating protein family  30.69 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3704  glycyl-radical enzyme activating protein family  30.69 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  29.01 
 
 
306 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>