More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003582 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  100 
 
 		 405 aa  828    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  81.66 
 
 		 403 aa  697    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  63.13 
 
 		 398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  62.81 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  62.81 
 
 		 396 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  62.31 
 
 		 396 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  61.56 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  61.56 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  62.06 
 
 		 396 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  62.31 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  60.85 
 
 		 392 aa  501  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  61.81 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  60.55 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  58.85 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  57.83 
 
 		 401 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  57.43 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  59.65 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  59.65 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  38.13 
 
 		 388 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  37.9 
 
 		 386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  36.39 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 		 390 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  36.09 
 
 		 410 aa  259  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  38.56 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  38.87 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 417 aa  249  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  36.2 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  38.83 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  37.15 
 
 		 424 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  33.43 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.86 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  31.73 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  35.86 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  30.34 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 		 448 aa  205  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  31.09 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  31.51 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32.27 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  31.87 
 
 		 419 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  31.71 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  35.58 
 
 		 436 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.43 
 
 		 390 aa  196  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  34.05 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  38.37 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  34.79 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  36.06 
 
 		 448 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 410 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 		 406 aa  189  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  34.77 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  32.15 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  37.45 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  37.87 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 		 406 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  35.79 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 413 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  33.22 
 
 		 419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  33.95 
 
 		 389 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  30.87 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 341 aa  156  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  31.54 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  32.79 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1030  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.239219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  32.82 
 
 		 352 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 		 304 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>