53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1223 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  100 
 
 		 77 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  85.33 
 
 		 75 aa  140  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  87.67 
 
 		 76 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  74.67 
 
 		 75 aa  130  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2412  glutaredoxin family protein  72 
 
 		 76 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00139714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  54.79 
 
 		 75 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  45.21 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  42.19 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  40 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  30.14 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  29.49 
 
 		 383 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  38.1 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.5 
 
 		 459 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  27.85 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  27.78 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  36 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  27.78 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  28.77 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  34.92 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  27.78 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  27.78 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  37.31 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  36 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  28 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  28.57 
 
 		 391 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1250  glutaredoxin  35.82 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.461543  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  29.58 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  29.17 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  24.68 
 
 		 384 aa  43.5  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 442 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  25.97 
 
 		 175 aa  42.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  34.78 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  35.21 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  27.78 
 
 		 81 aa  42  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  32.35 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  33.33 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  23.38 
 
 		 402 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3131  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  36.76 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  33.82 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  33.82 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0253  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  28.77 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>