86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0593 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0593  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  56.23 
 
 		 281 aa  278  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1055  putative membrane associated protease  57.3 
 
 		 275 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.103731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  39.73 
 
 		 299 aa  195  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  52.31 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  52.31 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  52.31 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  43.78 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  51.03 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  41.28 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  47.94 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  51.03 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5617  abortive infection protein  39.2 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.351592 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  42.36 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  42.36 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  42.36 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  42.36 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  42.36 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  42.36 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  42.36 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  38.31 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5732  abortive infection protein  39.6 
 
 		 281 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51176  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1390  CAAX protease family protein  42.31 
 
 		 412 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  35.85 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6485  abortive infection protein  38.81 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1834  abortive infection protein  42.35 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  35.48 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4418  abortive infection protein  35.02 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0787436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2270  hypothetical protein  33.86 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1322  abortive infection protein  36.04 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3405  abortive infection protein  37.31 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47750  Abortive infection like protein  32.62 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.090706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1056  hypothetical protein  36.16 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.699791 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4130  abortive infection protein  31.78 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110125  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3843  abortive infection protein  38.24 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4525  abortive infection protein  38.24 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5779  abortive infection protein  38.05 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3350  ferrous iron transport protein B  27.48 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0269256  normal  0.0624529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  36.56 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  37.5 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  32.86 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  36.99 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  39.73 
 
 		 420 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  35.23 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  30.65 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05801  membrane-associated protease  35.62 
 
 		 452 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  27.91 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  35.06 
 
 		 187 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0770  abortive infection protein  36.14 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  32.89 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  32.98 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  28.71 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  28.71 
 
 		 227 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  34.57 
 
 		 271 aa  45.8  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  28.71 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05421  membrane-associated protease  34.25 
 
 		 453 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.98 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  33.33 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  36.25 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  35.06 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0124  abortive infection protein  36.14 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  27.72 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.58 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  34.57 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.58 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  34.12 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  32.95 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  28.45 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  31.71 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  36.99 
 
 		 420 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  30.38 
 
 		 346 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05721  membrane-associated protease  31.51 
 
 		 453 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>