More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2834 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
318 aa  649    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.57 
 
 
317 aa  340  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.05 
 
 
316 aa  340  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  54.98 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.73 
 
 
316 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.87 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.41 
 
 
318 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.25 
 
 
317 aa  295  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.23 
 
 
314 aa  291  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.23 
 
 
317 aa  291  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.66 
 
 
333 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.51 
 
 
328 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
327 aa  239  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.95 
 
 
328 aa  238  8e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  41.4 
 
 
593 aa  228  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.71 
 
 
328 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 
326 aa  222  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  37.08 
 
 
339 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.08 
 
 
334 aa  212  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
397 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
408 aa  210  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.35 
 
 
336 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
324 aa  208  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
332 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  34.89 
 
 
323 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
323 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.18 
 
 
332 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.96 
 
 
309 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.18 
 
 
333 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 
341 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.87 
 
 
313 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
311 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
330 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 
327 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 
322 aa  203  3e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.07 
 
 
338 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 
326 aa  203  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.34 
 
 
336 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 
327 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
328 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 
331 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.62 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.58 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.99 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.69 
 
 
334 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 
337 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13991  putative nucleotide sugar epimerase  33.83 
 
 
344 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.417084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
324 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.49 
 
 
338 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  36.54 
 
 
308 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  37.97 
 
 
325 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 
373 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
335 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.81 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  37.95 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4099  hypothetical protein  38.96 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.104495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.69 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 
335 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 
337 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.78 
 
 
335 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
324 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  37.65 
 
 
335 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.69 
 
 
335 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
319 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
373 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.75 
 
 
341 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 
334 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 
334 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.59701  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.31 
 
 
339 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.08 
 
 
335 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 
312 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 
324 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.95 
 
 
335 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.69 
 
 
335 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.08 
 
 
336 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.86 
 
 
335 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  35.94 
 
 
337 aa  192  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
337 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.69 
 
 
336 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.09 
 
 
337 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 
337 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 
337 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 
337 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.586684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.99 
 
 
324 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 
368 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13971  putative nucleotide sugar epimerase  34.12 
 
 
342 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.69 
 
 
335 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
309 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.56 
 
 
324 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 
336 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.61 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0844  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.0945396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>