207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3086 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3086  YCII-related protein  100 
 
 		 104 aa  209  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4352  YCII-related protein  75.26 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00663803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0814  YCII-related protein  47.87 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.487046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3090  DGPFAETKE domain-containing protein  50 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.471864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3150  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3110  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.484936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  41.76 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0545  YCII-related protein  44.44 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.150513  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6291  DGPFAETKE family protein  43.21 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  43.53 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4552  hypothetical protein  41.18 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.40507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3811  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3713  DGPFAETKE family protein  41.18 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.832455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4100  DGPFAETKE family protein  38.2 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  42.35 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6406  DGPFAETKE family protein  41.38 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  37.65 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2285  hypothetical protein  41.18 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0910084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2314  DGPFAETKE family protein  42.39 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  40 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  40 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  38.82 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  41.3 
 
 		 389 aa  67  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  38.82 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  38.1 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  38.27 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  33.71 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  44.58 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  38.27 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  33.71 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  33.71 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  41.98 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  37.65 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  33.71 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  33.71 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  33.71 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  33.71 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  33.71 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  36.47 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  37.04 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  41.56 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  36.47 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3536  YCII-related protein  33.71 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0824  DGPFAETKE family protein  35.56 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  38.27 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  34.74 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  33.72 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4396  hypothetical protein  40.48 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759442  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3549  YCII-related  41.98 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3925  hypothetical protein  35.11 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3855  hypothetical protein  34.09 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.936414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  40 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  35.44 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7112  DGPFAETKE family protein  35.29 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3252  DGPFAETKE family protein  37.5 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.899565  normal  0.150715 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  40.7 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  39.51 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  32.63 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  35.29 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3319  hypothetical protein  32.94 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.419553  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0231  hypothetical protein  34.12 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  38.96 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  36.08 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  32.63 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  34.78 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6185  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353039  normal  0.674023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2629  YCII-related protein  45 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00535413  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4024  hypothetical protein  34.12 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2176  DGPFAETKE family protein  36.36 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.66649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  31.58 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  33.33 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  34.18 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  34.15 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  35.14 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  33.72 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  36.84 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4035  DGPF domain-containing protein  31.71 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  34.09 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  36.84 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  31.68 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  29.03 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  32.98 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  31.96 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  32.99 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  34.15 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46830  hypothetical protein  32.1 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000423585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  35.96 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  37.63 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  32.95 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  33.33 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  37.33 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  30.85 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  34.83 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  33.71 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  37.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2235  YCII-related protein  32.1 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.346545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  32.18 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  32.18 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  34.83 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>