More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1700 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 618 aa  1167    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  62.3 
 
 		 622 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  62.3 
 
 		 622 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  62.3 
 
 		 622 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  62.36 
 
 		 629 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  61.08 
 
 		 626 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  59.34 
 
 		 638 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  55.03 
 
 		 680 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  54.04 
 
 		 738 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.78 
 
 		 653 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.06 
 
 		 674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  56.3 
 
 		 657 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  55.87 
 
 		 674 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.02 
 
 		 674 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.11 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  51.27 
 
 		 705 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  52.47 
 
 		 699 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  52.93 
 
 		 719 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  52.35 
 
 		 713 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.44 
 
 		 616 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.29 
 
 		 688 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  46.67 
 
 		 637 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  51.99 
 
 		 690 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  41.98 
 
 		 614 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  38.73 
 
 		 680 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  40.88 
 
 		 669 aa  415  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  43.24 
 
 		 696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  43.17 
 
 		 653 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  41.2 
 
 		 650 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  39.79 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  40.52 
 
 		 660 aa  362  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.29 
 
 		 665 aa  355  2e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  60.24 
 
 		 788 aa  353  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  41.2 
 
 		 670 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  60.18 
 
 		 776 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  53.41 
 
 		 364 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  51.18 
 
 		 364 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  52.58 
 
 		 372 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  53.58 
 
 		 346 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  48.2 
 
 		 337 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  34.31 
 
 		 594 aa  297  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  48.14 
 
 		 346 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  49.69 
 
 		 345 aa  295  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  48.26 
 
 		 309 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  52.28 
 
 		 347 aa  294  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.2 
 
 		 351 aa  294  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.53 
 
 		 362 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  44.24 
 
 		 356 aa  292  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.38 
 
 		 362 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  54.9 
 
 		 340 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.04 
 
 		 337 aa  291  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.98 
 
 		 374 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  55.48 
 
 		 337 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.29 
 
 		 336 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  55.12 
 
 		 337 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  54.9 
 
 		 333 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.93 
 
 		 362 aa  287  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  49.09 
 
 		 351 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.09 
 
 		 335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.52 
 
 		 362 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.98 
 
 		 373 aa  284  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.04 
 
 		 362 aa  283  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  49.55 
 
 		 365 aa  283  8.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  50.62 
 
 		 363 aa  283  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  49.38 
 
 		 334 aa  283  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.29 
 
 		 364 aa  282  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.73 
 
 		 405 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.98 
 
 		 358 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.98 
 
 		 358 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  33.83 
 
 		 677 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.04 
 
 		 357 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.48 
 
 		 383 aa  278  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.73 
 
 		 369 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.85 
 
 		 341 aa  278  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.66 
 
 		 386 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.94 
 
 		 337 aa  276  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.67 
 
 		 370 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.93 
 
 		 394 aa  276  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.63 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.63 
 
 		 337 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.48 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.48 
 
 		 362 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  52.31 
 
 		 342 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.04 
 
 		 384 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.04 
 
 		 382 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  49.69 
 
 		 334 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.17 
 
 		 362 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  49.69 
 
 		 334 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  38.3 
 
 		 719 aa  273  5.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  59.65 
 
 		 566 aa  273  8.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  49.38 
 
 		 334 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.17 
 
 		 362 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.69 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.79 
 
 		 391 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.05 
 
 		 619 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.03 
 
 		 671 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.54 
 
 		 383 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.08 
 
 		 340 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.38 
 
 		 377 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  48.41 
 
 		 314 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>