More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0890 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  100 
 
 
359 aa  707    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  84.12 
 
 
359 aa  623  1e-177  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  78.89 
 
 
360 aa  588  1e-167  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  76.04 
 
 
358 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  43.01 
 
 
364 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  34.84 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.661089 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
361 aa  192  9e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  37.92 
 
 
367 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  36.54 
 
 
833 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  39.08 
 
 
347 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  32.76 
 
 
776 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  35.5 
 
 
827 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  37.67 
 
 
828 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  34.77 
 
 
841 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 
370 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.84 
 
 
828 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  35.37 
 
 
834 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  35.33 
 
 
832 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  33.81 
 
 
843 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 
370 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.97 
 
 
784 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.68 
 
 
784 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.68 
 
 
784 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.74 
 
 
348 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  30.35 
 
 
784 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  30.84 
 
 
842 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  30.84 
 
 
784 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  30.84 
 
 
784 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
842 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  32.15 
 
 
712 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  30.38 
 
 
785 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  35.51 
 
 
818 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  29.63 
 
 
827 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  32.41 
 
 
854 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
370 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.84 
 
 
837 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  32.58 
 
 
820 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 
843 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
370 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  30.59 
 
 
820 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  31.48 
 
 
833 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.93 
 
 
840 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  36.2 
 
 
347 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.57 
 
 
842 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.54 
 
 
841 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  31.94 
 
 
830 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
818 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  34.93 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  30 
 
 
816 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  33.62 
 
 
359 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  31.71 
 
 
828 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.45 
 
 
349 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  31.77 
 
 
364 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  31.62 
 
 
832 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  33.33 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  32.47 
 
 
363 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  31.87 
 
 
392 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.59 
 
 
832 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
821 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  29.31 
 
 
830 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  31.75 
 
 
388 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  32.38 
 
 
357 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  29.73 
 
 
810 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  32.27 
 
 
359 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  31.16 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  31.32 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  31.32 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  31.32 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.31 
 
 
392 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  32.86 
 
 
381 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  32.07 
 
 
364 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  29.23 
 
 
835 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
359 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  35.56 
 
 
346 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  28.92 
 
 
836 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  28.77 
 
 
387 aa  142  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1877  nucleotidyl transferase  31.54 
 
 
407 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29.26 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
828 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.94 
 
 
389 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  29.12 
 
 
361 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.52 
 
 
836 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  27.42 
 
 
835 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  26.61 
 
 
835 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.3 
 
 
836 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  28.3 
 
 
836 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.24 
 
 
364 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  32.12 
 
 
351 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  29.04 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  31.42 
 
 
359 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  29.46 
 
 
407 aa  136  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  32.66 
 
 
357 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1037  nucleotidyl transferase  30.92 
 
 
409 aa  135  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000127553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  27.9 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
835 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  33.73 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>